SQL Rechercher des paires de lignes avec la meilleure correspondance d'horodatage suivante

Aug 16 2020

Mon défi est de trouver des paires de lignes adjacentes par horodatage et de ne conserver que les paires avec une distance minimale d'un champ de valeur (valeurs positives de la différence)

Une table measurementcollecte les données de différents capteurs avec un horodatage et une valeur.

id | sensor_id | timestamp | value
---+-----------+-----------+------
 1 |         1 | 12:00:00  |     5
 2 |         2 | 12:01:00  |     6
 3 |         1 | 12:02:00  |     4
 4 |         2 | 12:02:00  |     7
 5 |         2 | 12:03:00  |     3
 6 |         1 | 12:05:00  |     3
 7 |         2 | 12:06:00  |     4
 8 |         2 | 12:07:00  |     5
 9 |         1 | 12:08:00  |     6

La valeur d'un capteur est valable depuis son horodatage jusqu'à l'horodatage de son prochain enregistrement (même sensor_id).

Représentation graphique

La ligne verte inférieure indique la distance des valeurs du capteur 1 (ligne bleue) et du capteur 2 (ligne rouge) au fil du temps.

Mon objectif est

  1. pour combiner uniquement les enregistrements de 2 capteurs qui correspondent à la logique d'horodatage (pour obtenir la ligne verte)
  2. pour trouver les minimums locaux de dinstance à
    • 12:01:00 (à 12:00:00 il n'y a pas d'enregistrement pour le capteur 2)
    • 12:05:00
    • 12:08:00

La vraie table réside dans une base de données PostgreSQL et contient environ 5 millions d'enregistrements de 15 capteurs.

Données de test

create table measurement (
    id serial,
    sensor_id integer,
    timestamp timestamp,
    value integer)
;

insert into measurement (sensor_id, timestamp, value)
values
(1, '2020-08-16 12:00:00', 5),
(2, '2020-08-16 12:01:00', 6),
(1, '2020-08-16 12:02:00', 4),
(2, '2020-08-16 12:02:00', 7),
(2, '2020-08-16 12:03:00', 3),
(1, '2020-08-16 12:05:00', 3),
(2, '2020-08-16 12:06:00', 4),
(2, '2020-08-16 12:07:00', 5),
(1, '2020-08-16 12:08:00', 6)
;

Mon approche

était de choisir 2 capteurs arbitraires (par certains sensor_ids), de faire une auto-jointure et de ne conserver pour tout enregistrement du capteur 1 que l'enregistrement du capteur 2 avec l'horodatage précédent (plus grands horodatages du capteur 2 avec l'horodatage du capteur 1 <= horodatage du capteur 2) .

select
*
from (
    select
    *,
    row_number() over (partition by m1.timestamp order by m2.timestamp desc) rownum
    from measurement m1
    join measurement m2
        on m1.sensor_id <> m2.sensor_id
        and m1.timestamp >= m2.timestamp
    --arbitrarily sensor_ids 1 and 2
    where m1.sensor_id = 1
    and m2.sensor_id = 2
) foo
where rownum = 1

union --vice versa

select
*
from (
    select
    *,
    row_number() over (partition by m2.timestamp order by m1.timestamp desc) rownum
    from measurement m1
    join measurement m2
        on m1.sensor_id <> m2.sensor_id
        and m1.timestamp <= m2.timestamp
    --arbitrarily sensor_ids 1 and 2
    where m1.sensor_id = 1
    and m2.sensor_id = 2
) foo
where rownum = 1
;

Mais cela renvoie une paire avec 12:00:00où le capteur 2 n'a pas de données (pas un gros problème)
et sur la table réelle l'exécution de l'instruction ne se termine pas après des heures (gros problème).

J'ai trouvé certaines questions similaires mais elles ne correspondent pas à mon problème

  • Rejoindre SQL le plus proche inférieur à la date
  • SQL Joindre la même table en fonction de l'horodatage et du niveau d'inventaire

Merci d'avance!

Réponses

2 GordonLinoff Aug 17 2020 at 00:30

La première étape consiste à calculer la différence à chaque horodatage. Une méthode utilise une jointure latérale et une agrégation conditionnelle:

select t.timestamp,
       max(m.value) filter (where s.sensor_id = 1) as value_1,
       max(m.value) filter (where s.sensor_id = 2) as value_2,
       abs(max(m.value) filter (where s.sensor_id = 2) -
           max(m.value) filter (where s.sensor_id = 1)
          ) as diff
from (values (1), (2)) s(sensor_id) cross join
     (select distinct timestamp
      from measurement
      where sensor_id in (1, 2)
     ) t left join lateral
     (select m.value
      from measurement m 
      where m.sensor_id = s.sensor_id and
            m.timestamp <= t.timestamp
      order by m.timestamp desc
      limit 1 
     ) m
     on 1=1
group by timestamp;

Maintenant, la question est de savoir quand la différence entre un minimum local. Pour vos exemples de données, les minima locaux sont tous longs d'une unité de temps. Cela signifie que vous pouvez les utiliser lag()et lead()les trouver:

with t as (
      select  t.timestamp,
              max(m.value) filter (where s.sensor_id = 1) as value_1,
              max(m.value) filter (where s.sensor_id = 2) as value_2,
              abs(max(m.value) filter (where s.sensor_id = 2) -
                  max(m.value) filter (where s.sensor_id = 1)
                 ) as diff
      from (values (1), (2)) s(sensor_id) cross join
           (select distinct timestamp
            from measurement
            where sensor_id in (1, 2)
           ) t left join lateral
           (select m.value
            from measurement m 
            where m.sensor_id = s.sensor_id and
                  m.timestamp <= t.timestamp
            order by m.timestamp desc
            limit 1 
           ) m
           on 1=1
      group by timestamp
     )
select *
from (select t.*,
             lag(diff) over (order by timestamp) as prev_diff,
             lead(diff) over (order by timestamp) as next_diff
      from t
     ) t
where (diff < prev_diff or prev_diff is null) and
      (diff < next_diff or next_diff is null);

Ce n'est peut-être pas une hypothèse raisonnable à faire. Donc, filtrez les valeurs en double adjacentes avant d'appliquer cette logique:

select *
from (select t.*,
             lag(diff) over (order by timestamp) as prev_diff,
             lead(diff) over (order by timestamp) as next_diff
      from (select t.*, lag(diff) over (order by timestamp) as test_for_dup
            from t
           ) t
      where test_for_dup is distinct from diff
     ) t
where (diff < prev_diff or prev_diff is null) and
      (diff < next_diff or next_diff is null)

Voici un violon db <>.

2 TheImpaler Aug 16 2020 at 16:14

Vous pouvez utiliser quelques jointures latérales. Par exemple:

with
t as (select distinct timestamp as ts from measurement)
select
  t.ts, s1.value as v1, s2.value as v2,
  abs(s1.value - s2.value) as distance
from t,
lateral (
  select value
  from measurement m 
  where m.sensor_id = 1 and m.timestamp <= t.ts
  order by timestamp desc
  limit 1
) s1,
lateral (
  select value
  from measurement m 
  where m.sensor_id = 2 and m.timestamp <= t.ts
  order by timestamp desc
  limit 1
) s2
order by t.ts

Résultat:

ts                     v1  v2  distance
---------------------  --  --  --------
2020-08-16 12:01:00.0   5   6         1
2020-08-16 12:02:00.0   4   7         3
2020-08-16 12:03:00.0   4   3         1
2020-08-16 12:05:00.0   3   3         0
2020-08-16 12:06:00.0   3   4         1
2020-08-16 12:07:00.0   3   5         2
2020-08-16 12:08:00.0   6   5         1

Voir l'exemple d'exécution sur DB Fiddle .

De plus, si vous voulez tous les horodatages , même ceux qui ne correspondent pas 12:00:00, vous pouvez faire:

with
t as (select distinct timestamp as ts from measurement)
select
  t.ts, s1.value as v1, s2.value as v2,
  abs(s1.value - s2.value) as distance
from t
left join lateral (
  select value
  from measurement m 
  where m.sensor_id = 1 and m.timestamp <= t.ts
  order by timestamp desc
  limit 1
) s1 on true
left join lateral (
  select value
  from measurement m 
  where m.sensor_id = 2 and m.timestamp <= t.ts
  order by timestamp desc
  limit 1
) s2 on true
order by t.ts

Dans ces cas, il n'est cependant pas possible de calculer la distance.

Résultat:

ts                     v1      v2  distance
---------------------  --  ------  --------
2020-08-16 12:00:00.0   5  <null>    <null>
2020-08-16 12:01:00.0   5       6         1
2020-08-16 12:02:00.0   4       7         3
2020-08-16 12:03:00.0   4       3         1
2020-08-16 12:05:00.0   3       3         0
2020-08-16 12:06:00.0   3       4         1
2020-08-16 12:07:00.0   3       5         2
2020-08-16 12:08:00.0   6       5         1
1 MikeOrganek Aug 16 2020 at 16:22

Le remplissage des valeurs manquantes nécessite des fonctions de fenêtre et un produit cartésien de chaque minute traversée avec vos deux capteurs.

Le invarscte accepte les paramètres.

with invars as (
  select '2020-08-16 12:00:00'::timestamp as start_ts,
         '2020-08-16 12:08:00'::timestamp as end_ts,
         array[1, 2] as sensor_ids
), 

Créer la matrice de minutexsensor_id

calendar as (
  select g.minute, s.sensor_id, 
         sensor_ids[1] as sid1,
         sensor_ids[2] as sid2
    from invars i
   cross join generate_series(
           i.start_ts, i.end_ts, interval '1 minute'
         ) as g(minute)
   cross join unnest(i.sensor_ids) as s(sensor_id)
),

Trouvez mgrppour chaque fois qu'une nouvelle valeur est disponible à partir d'unsensor_id

gaps as (
  select c.minute, c.sensor_id, m.value,
         sum(case when m.value is null then 0 else 1 end)
            over (partition by c.sensor_id 
                      order by c.minute) as mgrp,
         c.sid1, c.sid2
    from calendar c
         left join measurement m
                on m.timestamp = c.minute 
               and m.sensor_id = c.sensor_id
), 

Interpoler les valeurs manquantes en reportant la valeur la plus récente

interpolated as (
  select minute, 
         sensor_id,
         coalesce(
           value, first_value(value) over
                    (partition by sensor_id, mgrp
                         order by minute)
         ) as value, sid1, sid2
    from gaps
)

Effectuez le distancecalcul ( sum()aurait pu être max()ou - min()cela ne fait aucune différence.

select minute,
       sum(value) filter (where sensor_id = sid1) as value1,
       sum(value) filter (where sensor_id = sid2) as value2, 
       abs(
         sum(value) filter (where sensor_id = sid1) 
         - sum(value) filter (where sensor_id = sid2)
       ) as distance
  from interpolated
 group by minute
 order by minute;

Résultats:

| minute                   | value1 | value2 | distance |
| ------------------------ | ------ | ------ | -------- |
| 2020-08-16T12:00:00.000Z | 5      |        |          |
| 2020-08-16T12:01:00.000Z | 5      | 6      | 1        |
| 2020-08-16T12:02:00.000Z | 4      | 7      | 3        |
| 2020-08-16T12:03:00.000Z | 4      | 3      | 1        |
| 2020-08-16T12:04:00.000Z | 4      | 3      | 1        |
| 2020-08-16T12:05:00.000Z | 3      | 3      | 0        |
| 2020-08-16T12:06:00.000Z | 3      | 4      | 1        |
| 2020-08-16T12:07:00.000Z | 3      | 5      | 2        |
| 2020-08-16T12:08:00.000Z | 6      | 5      | 1        |

---

[View on DB Fiddle](https://www.db-fiddle.com/f/p65hiAFVT4v3TrjTPbrZnC/0)

Veuillez voir ce violon fonctionnel .

1 wildplasser Aug 16 2020 at 16:40

Fonctions de la fenêtre et vérification des voisins. (vous aurez besoin d'un anti-selfjoin supplémentaire pour supprimer les doublons et inventer un bris d'égalité pour le problème du mariage stable )


SELECT id,sensor_id, ztimestamp,value
        -- , prev_ts, next_ts
        , (ztimestamp - prev_ts) AS prev_span
        , (next_ts - ztimestamp) AS next_span
        , (sensor_id <> prev_sensor) AS prev_valid
        , (sensor_id <> next_sensor) AS next_valid
        , CASE WHEN (sensor_id <> prev_sensor AND sensor_id <> next_sensor) THEN
                CASE WHEN (ztimestamp - prev_ts) < (next_ts - ztimestamp) THEN prev_id ELSE next_id END
        WHEN (sensor_id <> prev_sensor) THEN prev_id
        WHEN (sensor_id <> next_sensor) THEN next_id
        ELSE NULL END AS best_neigbor
 FROM (
        SELECT id,sensor_id, ztimestamp,value
        , lag(id) OVER www AS prev_id
        , lead(id) OVER www AS next_id
        , lag(sensor_id) OVER www AS prev_sensor
        , lead(sensor_id) OVER www AS next_sensor
        , lag(ztimestamp) OVER www AS prev_ts
        , lead(ztimestamp) OVER www AS next_ts
        FROM measurement
        WINDOW www AS (order by ztimestamp)
        ) q
ORDER BY ztimestamp,sensor_id
        ;

Résultat:


DROP SCHEMA
CREATE SCHEMA
SET
CREATE TABLE
INSERT 0 9
 id | sensor_id |     ztimestamp      | value | prev_span | next_span | prev_valid | next_valid | best_neigbor 
----+-----------+---------------------+-------+-----------+-----------+------------+------------+--------------
  1 |         1 | 2020-08-16 12:00:00 |     5 |           | 00:01:00  |            | t          |            2
  2 |         2 | 2020-08-16 12:01:00 |     6 | 00:01:00  | 00:01:00  | t          | t          |            3
  3 |         1 | 2020-08-16 12:02:00 |     4 | 00:01:00  | 00:00:00  | t          | t          |            4
  4 |         2 | 2020-08-16 12:02:00 |     7 | 00:00:00  | 00:01:00  | t          | f          |            3
  5 |         2 | 2020-08-16 12:03:00 |     3 | 00:01:00  | 00:02:00  | f          | t          |            6
  6 |         1 | 2020-08-16 12:05:00 |     3 | 00:02:00  | 00:01:00  | t          | t          |            7
  7 |         2 | 2020-08-16 12:06:00 |     4 | 00:01:00  | 00:01:00  | t          | f          |            6
  8 |         2 | 2020-08-16 12:07:00 |     5 | 00:01:00  | 00:01:00  | f          | t          |            9
  9 |         1 | 2020-08-16 12:08:00 |     6 | 00:01:00  |           | t          |            |            8
(9 rows)