Comemorando ex-alunos

Nov 25 2022
Nada - absolutamente nada - supera ver um pesquisador em início de carreira se transformar em um cientista e líder brilhante. Esta semana trouxe para o foco os sucessos de nossos ex-alunos de laboratório.

Nada - absolutamente nada - supera ver um pesquisador em início de carreira se transformar em um cientista e líder brilhante. Esta semana trouxe para o foco os sucessos de nossos ex-alunos de laboratório.

Citar como: Kamoun, S. (2022). Celebrando ex-alunos.Zenodo https://doi.org/10.5281/zenodo.7358976

Nesta semana chuvosa e fria de 21 de novembro de 2022, uma série de encontros e eventos relacionados a ex-alunos trouxe para o foco a sensação emocionante de reencontrar velhos amigos e colegas. Nada - absolutamente nada - supera ver um pesquisador em início de carreira se transformar em um cientista e líder brilhante. Estas são suas histórias.

Caçadores de Oxford

O laboratório do meu colega da Universidade de Oxford, Renier van der Hoorn , foi pioneiro em estudos sobre como as hidrolases de plantas são apanhadas em uma corrida armamentista coevolutiva com inibidores de patógenos, ajudando assim a definir a importância da imunidade apoplástica. A busca por novos inibidores de patógenos continua. Tee e Jie são essenciais na equipe de caçadores de inibidores de hidrolase de Renier . Na segunda-feira, parei no laboratório de Renier para acompanhar seu trabalho e me encontrei com Tee e Jie, entre outros.

Tee Nattapong juntou-se ao laboratório em julho de 2014 como parte da International Undergraduate Summer School , um programa organizado conjuntamente pelo John Innes Center e The Sainsbury Laboratory (TSL). Ele trabalhou em estreita colaboração com um cientista experiente no laboratório Vladimir Nekrasov - atualmente na Rothamsted Research.

Nossos alunos de graduação do verão de 2014: Nattapong (Tee) Sanguankiattichai da Tailândia via Imperial College e Egem Ozbudak, Instituto de Tecnologia de Izmir, Turquia. Nattapong está trabalhando com Vladimir Nekrasov e Egem com Yasin Dagdas.

Tee passou a fazer um mestrado no Imperial College , fazendo pesquisas e contribuindo para um estudo sobre efetores de patógenos com outro ex-aluno do laboratório, Tolga Bozkurt , antes de se mudar para Oxford para fazer seu doutorado com Gail Preston e atual pós-doutorado com Renier. Verifique o recente artigo de revisão de Tee sobre como as bactérias superam a detecção de flagelina pelas plantas .

Jie Huang é outro membro dos caçadores de Oxford que está conectado ao nosso laboratório. Antes de se mudar para Oxford, Jie trabalhou com o aluno de laboratório Suomeng Dong na Nanjing Agricultural University (NJAU). Na NJAU, Jie publicou vários artigos sobre efetores do assassino de plantas Phytophthora , demonstrando mais recentemente que o patógeno modula o splicing alternativo do mRNA do hospedeiro .

Vencedores do Euro

As bolsas do Conselho Europeu de Pesquisa (ERC) fornecem financiamento generoso de 5 anos para cientistas em todas as fases da carreira. As bolsas iniciais do ERC são oferecidas a candidatos com menos de 7 anos de experiência após o doutorado. Esses subsídios podem turbinar o trabalho dos pesquisadores em início de carreira (ECRs), fornecendo financiamento estável que permite pesquisas arriscadas e exploratórias - exatamente o que os ECRs devem ser incentivados a fazer. Terça-feira trouxe a maravilhosa notícia de que um cientista do Sainsbury Lab, Thorsten Langner , e dois ex-alunos, Miriam Oses-Ruiz e Annis Richardson , receberam um #ERCStg na última rodada de financiamento de 2022 .

Como visto no site do The Sainsbury Lab , a notícia resultou em comemorações jubilosas não apenas pelos candidatos aprovados, mas também por seus colegas:

“ Ficou claro pela energia animada na celebração dupla improvisada do laboratório que os membros do TSL veem os sucessos dos pesquisadores em início de carreira como nossas realizações de maior orgulho. Como um instituto voltado para o futuro, acreditamos que nosso maior impacto para um futuro sustentável será por meio do desenvolvimento de líderes em ciência vegetal. ”

Na verdade, o que mais traz alegria do que testemunhar o sucesso de nossos ECRs?

Thorsten e Miriam são Master Blasters, ambos trabalhando em aspectos da biologia e patologia do temível fungo conhecido como Magnaporthe oryzae . O projeto Thorsten se concentra em uma cepa pandêmica desse fungo, que está causando estragos no trigo no sudeste da Ásia e na África . Como escreveu Thorsten, ele planeja “ projetar receptores imunológicos do trigo contra o fungo pandêmico da brusone do trigo, transformando os pontos fracos do hospedeiro em uma estratégia de defesa ”.

Projeto PANDEMIC de Thorsten Langner sobre o fungo da brusone do trigo.

Thorsten pretende atingir seus objetivos concentrando-se nos genes efetores de virulência que o fungo carrega em uma parte estranha de seu genoma, conhecida como minicromossomo.

Nos últimos anos, Thorsten adotou a ciência aberta e a pré-impressão, conforme discutido neste post anterior . Por exemplo, seu artigo principal sobre minicromossomos foi precedido por miniartigos de método e conjunto de dados que ele compartilhou com a comunidade antes da publicação formal na revista PLOS Pathogens. Sua adoção da ciência aberta foi devidamente notada pelos membros do painel do ERC, conforme escreveram no resumo da decisão: “ O compromisso do candidato com a publicação de pré-impressão e o compartilhamento de dados abertos são especialmente louváveis. ”Parabéns Thorsten. Talvez este exemplo mostre que é preciso mais do que publicar em certos periódicos para convencer revisores e painelistas do valor e impacto de seu trabalho.

Um vislumbre do que está por vir — As agências de financiamento estão avaliando cada vez mais a dedicação dos candidatos à ciência aberta.

Miriam é atualmente Ramon y Cajal Research Fellow na Universidade de Navarra, na Espanha. Ela fez seu Ph.D. no laboratório da Universidade de Exeter do mago do fungo Nick Talbot antes de se juntar a ele em Norwich quando ele assumiu o cargo de Diretor Executivo da TSL. No entanto, a conexão de Miriam com TSL remonta a antes de seu doutorado. Em 2008, ela fez um pré-doutorado em nosso grupo trabalhando com Joe Win em projetos de patologia molecular de plantas. Inspirem-se na Miriam, jovens! Faça um pré-doutorado antes de iniciar seu doutorado .

Despedida de Miriam Oses-Ruiz que regressa a Pamplona, ​​Espanha, após terminar o seu estágio. [15 de outubro de 2008]

Miriam quer “conhecer o inimigo” . Ela pretende entender o processo de heterogeneidade celular no fungo da brusone e determinar como ele se relaciona com a capacidade do patógeno de infectar plantas. Ela fará isso estudando as estruturas fúngicas conhecidas como apressórios, que produzem enorme força física para romper a superfície da planta e penetrar no tecido vegetal.

Miriam e os apressórios.

Annis está no Instituto de Ciências Moleculares de Plantas da Universidade de Edimburgo , onde dirige o Plant Shape Lab . O Laboratório pretende perceber como as folhas e as flores ganham forma, um programa de investigação que será certamente potenciado pelo financiamento do ERC.

Mais de 10 anos atrás, antes de se dedicar ao desenvolvimento de plantas, Annis ingressou em nosso laboratório para uma rotação de PhD com Sylvain Raffaele , um membro sênior de nossa equipe que, alguns anos depois, recebeu sua própria bolsa ERC enquanto administrava a Imunidade Quantitativa em Plants (QIP) Lab no INRAe na França.

Apesar de sua curta permanência no laboratório, Annis fez contribuições importantes para o trabalho que Sylvain, Tolga e outros estavam fazendo na época na identificação de processos celulares do hospedeiro que o patógeno irlandês da fome da batata Phytophthora infestans coopta para infectar plantas. Isso resultou na coautoria de Annis em um artigo que foi destaque na capa da revista Plant Physiology .

Bozkurt, Richardson et al. capa exibindo o poderoso patógeno da requeima da batata invadindo o tecido da planta.

Prêmio Rosalind Franklin

Na noite de terça-feira, alguns de nós fomos à Royal Society em Londres para assistir à palestra de Diane Saunders , “como enganar um assassino de cereais”. Diane é patologista de plantas no John Innes Centre. Ela foi reconhecida pela Royal Society não apenas por sua excelente pesquisa - ela é outra premiada do ERC - mas também pelo programa #WomeninWheat que ela montou para inspirar e ajudar a promover as carreiras dos ECRs.

Diane ingressou no Kamoun Lab em janeiro de 2010, após concluir seu doutorado com Nick Talbot – então na Universidade de Exeter – trabalhando no fungo da explosão. Estamos todos conectados em algum grau. A rede acadêmica é tão interligada quanto uma malha de hifas de fungos.

[3 de janeiro de 2010] Novo membro do laboratório: Diane Saunders, anteriormente uma estudante de doutorado com Nick Talbot, Universidade de Exeter.

A palestra de Diane na Royal Society foi uma master class de comunicação científica. O dela é mais um exemplo de como ser um cientista de sucesso exige mais do que apenas procurar artigos em certas revistas. Posso rastrear o amor de Diane pelo scicom ao trabalho que ela fez no surto de cinzas a partir de 2012, quando ela estava no TSL. Naquela época, trabalhando com Kentaro Yoshida - agora na Universidade de Kyoto - e com o próprio Dan MacLean da TSL , Diane foi pioneira na aplicação de ciência aberta e sequenciamento rápido do genoma para emergências de saúde vegetal - uma abordagem que ela passou a aplicar às doenças da ferrugem do trigo e que usamos para investigar a atual pandemia de brusone do trigo .

Diane Saunders, aqui ao fundo com Kentaro Yoshida, Anne Edwards e com Dan MacLean apresentando o projeto OpenAshDieback.

Que semana, hein?

“Capitão, é quarta-feira”, diz o famoso meme de Tintin . Há muito mais histórias de ex-alunos para compartilhar. Alguns deles podem ser encontrados através desta busca no Twitter .

Agradecimentos

Este post é dedicado a todos os membros do laboratório, antigos e atuais. Obrigado por compartilhar e espalhar sua paixão pela ciência.