Consultar CSV diretamente com DuckDB
Você recebeu uma das seguintes tarefas:
— carregar um novo arquivo csv no BigQuery para análise
— adicionar um novo arquivo ao seu pipeline de dados
— fazer algumas verificações de qualidade de dados leves em um arquivo drop de fornecedores
Você busca o ferramental mais próximo e familiar conhecido por você. Normalmente é para carregar tudo no Excel, né? O que faz você continuar. Mas o arquivo tem 600 MB e mais de 1,2 milhão de linhas. O Excel informa que só pode carregar o arquivo parcialmente.
Ok, então o que vem a seguir?
Você pode estar no GCP/BigQuery, então clica e solta, mas o BQ diz que a posição 1023845 não é boa. Como você encontra essa posição de byte em um arquivo? <suspiro>
Você pesquisa no Stackoverflow e eles dizem para você usar pandas. Ele leva você até lá, mas sua velocidade é prejudicada porque você esqueceu todos os comandos. Talvez você use o ChatGPT, mas precisa de respostas imediatamente e rapidamente.
Não seria legal apenas `selecionar * de output.csv`?
Bem, você pode totalmente.
Passo 1
brew install duckdb
> duckdb
D> select * from ‘output.csv*’
Você pode até fazer `data/*.csv`, ou até mesmo outras extensões como `data/*.parquet`.
Solução de problemas
Portanto, a carga do csv não está indo tão bem. Você começou com duckdb, ele diz
Error: Invalid Input Error: Could not convert string ‘Column_1’ to INT32
in column “Column_1”, at line 100002.
A primeira coisa que devemos fazer é criar uma exibição em cima do seu csv com alguns números de linha para que você possa começar a verificar o arquivo e fazer algumas verificações de qualidade de toque leve.
create sequence seq_id start 1;
D> create or replace view test_1 as SELECT nextval(‘seq_id’) as seq_id, *
from read_csv(‘output.csv’, ALL_VARCHAR=1, AUTO_DETECT=TRUE);
couple of things here, of reference is https://duckdb.org/docs/data/csv
- Você tem alguns dados ruins. O Duckdb faz amostras a cada 100 linhas e adivinha o tipo de coluna. Alguns dados em sua coluna não são o que deveriam ser. `ALL_VARCHAR` permite que você carregue tudo, independentemente do tipo de análise
— `AUTO_DETECT` significa usar a primeira linha, adivinhar quantas colunas devem existir. Caso contrário, teríamos que digitá-los manualmente, `columns={'Column_1,', 'Column_2…}'`
Neste ponto, como nossa sequência está sempre contando, é um bom momento para bloqueá-la e materializar a exibição com nossos números de linha.
create table test_1_mv as (select * from test_1);
— it seems that line numbers in errors are zero-indexed
— however you cannot start a sequence from 0
— so we need to subtract `1` from the id
select * from test_1 where seq_id = 100001
┌────────┬───────────────┬──────────────┬──┐
│ seq_id │ Column_1 │ Column_2 │ │
│ int64 │ varchar │ varchar │ │
├────────┼───────────────┼──────────────┼──┤
│ 100001 │ Column_1_text │ Column_2_text│ │
├────────┴───────────────┴──────────────┴──┤
│ 1 rows │
└──────────────────────────────────────────┘
Vamos encontrar todas as linhas ofensivas. Meu primeiro pensamento é procurar todas as linhas que tenham `Column_1_text` nelas.
select * from test_1 where column_1 = ‘Column_1_text’;
select * from test_1
where regexp_matches(Column_1, ‘[a-zA-Z]’)
delete from test_1_mv where seq_id in (select seq_id from test_1_mv
where regexp_matches(Column_1, ‘[a-zA-Z]’));
Escrevendo o novo arquivo — Exportar
Para exportar os dados de uma tabela para um arquivo CSV, use a instrução `COPY`.
COPY test_1_mv TO ‘output_cleaned.csv’ (HEADER, DELIMITER ‘,’);





































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