encerramento de 2022

2022 foi um ano agridoce para mim.

Fizemos um tremendo progresso no desenvolvimento contínuo de nossa plataforma computacional de descoberta de medicamentos baseada em física e ML. Construímos um motor de campo de força de última geração com precisão de ponta e cobertura química abrangente, reprojetamos um programa robusto e adaptável de previsão de energia livre de ligação com rendimento, robustez e precisão incomparáveis, desenvolvemos novos métodos para integrar dados experimentais de biofísica em simulações avançadas de dinâmica molecular para construir modelos realistas de estruturas e dinâmicas de proteínas, e construímos métodos e modelos para aplicações específicas da modalidade para permitir o design racional baseado em estrutura e dinâmica de degradadores de proteínas alvo e para ajudar na descoberta de inibidores covalentes.

Mais importante, aplicamos com sucesso essas ferramentas computacionais para permitir e acelerar dramaticamente a descoberta real de medicamentos, como projetar novos degradadores ativos com base em estruturas complexas ternárias modeladas em nossas simulações que não foram observadas anteriormente, mas posteriormente confirmadas em cristalografia, prevendo com precisão a eficácia da degradação de novos moléculas bifuncionais e enriquecendo a porcentagem de designs de inibidores ativos em 5 vezes contra um alvo oncológico de alto valor, mas desafiador.

Publicamos vários artigos relatando a ciência subjacente à nossa plataforma computacional:

• Cálculos precisos de energia livre de ligação para múltiplas moléculas usando uma rede de medição ideal de diferenças de pares
• Prevendo a base estrutural da degradação de proteínas alvo integrando simulações de dinâmica molecular com espectrometria de massa estrutural
• Modelagem do efeito da cooperatividade na formação do complexo ternário e na degradação de proteínas direcionadas mediada por degradadores heterobifuncionais
• Caracterizando a Flexibilidade do Receptor para Prever Mutações que Levam à Adaptação Humana da Hemaglutinina Influenza
• O aumento lento, mas constante, dos cálculos de energia livre de ligação na descoberta de medicamentos

A parte amarga do ano é que me separei de muitos de meus colegas talentosos e dedicados que compartilham a mesma paixão pela descoberta de medicamentos. Desejo a todos vocês, meus amigos!

Agora estou ansioso por um novo ano de oportunidades. Como um grupo independente com foco em computação (como contemplei nesta postagem do blog ), traremos a plataforma que impulsionou a descoberta de medicamentos na Silicon Therapeutics e Roivant Discovery para mais projetos de descoberta de medicamentos na ampla comunidade de descoberta de medicamentos, para ampliar o valor da plataforma e ajudar a descobrir mais medicamentos para os pacientes, mais rapidamente. Por favor fique atento.

Feliz Ano Novo e boas pesquisas!