DNA Badak Berbulu Dipulihkan Dari Fosil Kotoran Hyena

Fosil kotoran dari zaman Pleistosen telah mengungkap DNA mitokondria badak berbulu, yang genomnya belum pernah dirakit sebelumnya. Kotoran purba tersebut tidak dikeluarkan oleh badak purba, melainkan oleh hyena—hewan yang tampaknya memangsa herbivora raksasa tersebut sebelum ia juga mati pada masa Paleolitik Tengah.

Tim memeriksa dua koprolit dari gua berbeda di Jerman, dan satu koprolit hyena yang digali pada tahun 1930-an. Sampel tersebut menghasilkan DNA hyena dan badak—yang terakhir cukup untuk menyusun genom, meskipun terjadi degradasi. Penelitian tim ini dipublikasikan minggu lalu di jurnal The Royal Society Biology Letters.

“Kami melihat badak berbulu menunjukkan garis keturunan mitokondria yang berbeda di seluruh wilayah jelajahnya,” kata Peter Seeber, ahli biologi molekuler di Universitas Konstanz dan penulis utama studi tersebut, melalui email ke Gizmodo. “Hal ini menunjukkan kemungkinan sejarah kompleks pembagian populasi di seluruh keberadaannya sebagai suatu spesies, dan penelitian menunjukkan bahwa kita dapat mengungkap sejarah ini menggunakan DNA purba dengan relatif mudah.”

Koprolit kaya dengan informasi tentang benda-benda yang sudah lama mati. Pada tahun 2019, sebuah tim di Texas melaporkan kotoran manusia berusia 1.500 tahun yang berisi bukti bahwa, eh, produsennya memakan  seekor ular derik utuh , lengkap dengan taringnya. Koprolit berusia 14.000 tahun yang ditemukan di Oregon antara tahun 2002 dan 2010 ternyata adalah manusia , menurut sebuah makalah tahun 2020, yang memberikan petunjuk tentang kehadiran manusia modern awal di Amerika Utara. Dan seperti dilansir Gizmodo awal tahun ini , beberapa koprolit memiliki bekas gigitan, mungkin karena makhluk purba lainnya salah mengira kotorannya sebagai makanan.

Semua DNA yang ditemukan dari koprolit yang baru-baru ini dianalisis adalah milik hyena tutul ( Crocuta crocuta ) yang masih ada dan badak berbulu ( Coelodonta antiquitatis ) yang telah punah. Tidak jelas dari sisa-sisa kotorannya apakah badak tersebut memangsa hyena atau hanya pemakan bangkai. Meskipun terjadi degradasi DNA, tim menyimpulkan bahwa badak berbulu Eropa secara genetik berbeda dari badak Siberia.

“Hasil kami hanya berasal dari satu mitogenom yang hampir lengkap dan satu lagi yang sangat terfragmentasi, sehingga hanya sekilas, dan diperlukan lebih banyak data untuk mendapatkan kesimpulan yang kuat,” kata Seeber. “Tetapi ini menunjukkan bahwa kita akan dapat menelusuri sejarah spesies menggunakan berbagai sampel dan tidak hanya menggunakan temuan tulang klasik.”

Jadi pindahlah, DNA tulang yang membosankan. Kotoran yang menjadi fosil mengandung harta tersendiri, berkat cara-cara modern untuk mengeluarkannya.

Lebih lanjut: Fosil Kotoran Manusia Menunjukkan Penjelajah Purba Memakan Seluruh Ular Berbisa—Termasuk Taringnya