AWS EKS Spark 3.0, błąd Hadoop 3.2 - NoClassDefFoundError: com / amazonaws / services / s3 / model / MultiObjectDeleteException

Nov 01 2020

Używam Jupyterhub na EKS i chcę wykorzystać funkcje EKS IRSA do uruchamiania obciążeń Spark na K8. Miałem wcześniej doświadczenie w używaniu Kube2IAM, ale teraz planuję przenieść się do IRSA.

Ten błąd nie jest spowodowany przez IRSA, ponieważ konta usług są idealnie podłączane do strąków Driver i Executor i mogę uzyskać dostęp do S3 przez CLI i SDK z obu. Ten problem jest związany z uzyskiwaniem dostępu do S3 przy użyciu platformy Spark w wersji 3.0 / Hadoop 3.2

Py4JJavaError: Wystąpił błąd podczas wywoływania None.org.apache.spark.api.java.JavaSparkContext. : java.lang.NoClassDefFoundError: com / amazonaws / services / s3 / model / MultiObjectDeleteException

Używam następujących wersji -

  • APACHE_SPARK_VERSION = 3.0.1
  • HADOOP_VERSION = 3.2
  • aws-java-sdk-1.11.890
  • hadoop-aws-3.2.0
  • Python 3.7.3

Testowałem również z inną wersją.

  • aws-java-sdk-1.11.563.jar

Proszę o pomoc w znalezieniu rozwiązania, jeśli ktoś napotkał ten problem.

PS: To również nie jest błąd dotyczący zasad, ponieważ zasady uprawnień są w porządku.

Odpowiedzi

2 PrateekDubey Nov 01 2020 at 01:55

Wreszcie wszystkie problemy są rozwiązane za pomocą poniższych słoików -

  • hadoop-aws-3.2.0.jar
  • aws-java-sdk-bundle-1.11.874.jar (https://mvnrepository.com/artifact/com.amazonaws/aws-java-sdk-bundle/1.11.874)

Każdy, kto próbuje uruchomić Sparka na EKS przy użyciu IRSA, to jest poprawna konfiguracja Spark -

from pyspark.sql import SparkSession

spark = SparkSession.builder \
        .appName("pyspark-data-analysis-1") \
        .config("spark.kubernetes.driver.master","k8s://https://xxxxxx.gr7.ap-southeast-1.eks.amazonaws.com:443") \
        .config("spark.kubernetes.namespace", "jupyter") \
        .config("spark.kubernetes.container.image", "xxxxxx.dkr.ecr.ap-southeast-1.amazonaws.com/spark-ubuntu-3.0.1") \
        .config("spark.kubernetes.container.image.pullPolicy" ,"Always") \
        .config("spark.kubernetes.authenticate.driver.serviceAccountName", "spark") \
        .config("spark.kubernetes.authenticate.executor.serviceAccountName", "spark") \
        .config("spark.kubernetes.executor.annotation.eks.amazonaws.com/role-arn","arn:aws:iam::xxxxxx:role/spark-irsa") \
        .config("spark.hadoop.fs.s3a.aws.credentials.provider", "com.amazonaws.auth.WebIdentityTokenCredentialsProvider") \
        .config("spark.kubernetes.authenticate.submission.caCertFile", "/var/run/secrets/kubernetes.io/serviceaccount/ca.crt") \
        .config("spark.kubernetes.authenticate.submission.oauthTokenFile", "/var/run/secrets/kubernetes.io/serviceaccount/token") \
        .config("spark.hadoop.fs.s3a.multiobjectdelete.enable", "false") \
        .config("spark.hadoop.fs.s3a.impl", "org.apache.hadoop.fs.s3a.S3AFileSystem") \
        .config("spark.hadoop.fs.s3a.fast.upload","true") \
        .config("spark.executor.instances", "1") \
        .config("spark.executor.cores", "3") \
        .config("spark.executor.memory", "10g") \
        .getOrCreate()
1 VitaminGauGau Nov 02 2020 at 00:49

Może sprawdzić tego bloga (https://medium.com/swlh/how-to-perform-a-spark-submit-to-amazon-eks-cluster-with-irsa-50af9b26cae) z:

  • Spark 2.4.4
  • Hadoop 2.7.3
  • AWS SDK 1.11.834

Przykład wysyłania iskry to

/opt/spark/bin/spark-submit \
    --master=k8s://https://4A5<i_am_tu>545E6.sk1.ap-southeast-1.eks.amazonaws.com \
    --deploy-mode cluster \
    --name spark-pi \
    --class org.apache.spark.examples.SparkPi \
    --conf spark.kubernetes.driver.pod.name=spark-pi-driver \
    --conf spark.kubernetes.container.image=vitamingaugau/spark:spark-2.4.4-irsa \
    --conf spark.kubernetes.namespace=spark-pi \
    --conf spark.kubernetes.authenticate.driver.serviceAccountName=spark-pi \
    --conf spark.kubernetes.authenticate.executor.serviceAccountName=spark-pi \
    --conf spark.hadoop.fs.s3a.aws.credentials.provider=com.amazonaws.auth.WebIdentityTokenCredentialsProvider \
    --conf spark.kubernetes.authenticate.submission.caCertFile=/var/run/secrets/kubernetes.io/serviceaccount/ca.crt \
    --conf spark.kubernetes.authenticate.submission.oauthTokenFile=/var/run/secrets/kubernetes.io/serviceaccount/token \
    local:///opt/spark/examples/target/scala-2.11/jars/spark-examples_2.11-2.4.4.jar 20000