Presentazione di Entheogen Data Commons e Nagoya-NFT.

Feb 01 2023
La Entheome Foundation, nata come Entheogen Genome Project, è un'iniziativa internazionale per preservare e comprendere gli organismi biologici che sono stati storicamente utilizzati per scopi rituali o sacramentali. Questi includono oltre 200 diverse specie fungine, centinaia di altre specie di piante e cactus e persino qualche dozzina di animali rari e affascinanti come le spugne marine enteogene.

La Entheome Foundation, nata come Entheogen Genome Project, è un'iniziativa internazionale per preservare e comprendere gli organismi biologici che sono stati storicamente utilizzati per scopi rituali o sacramentali. Questi includono oltre 200 diverse specie fungine, centinaia di altre specie di piante e cactus e persino qualche dozzina di animali rari e affascinanti come le spugne marine enteogene.

Come parte dei nostri sforzi, raccogliamo e biobanchiamo campioni biologici con l'obiettivo finale di preservare le loro informazioni genetiche e ottenere indizi sulla loro evoluzione, tassonomia, storia etnobotanica e applicazioni future. Tuttavia, farlo non è un compito facile.

Sfide con la ricerca sulla genomica: Mentre il sequenziamento del DNA sta diventando sempre più conveniente, ci sono ancora grandi limiti alla decodifica del codice della vita. La scoperta di informazioni genomiche non solo richiede attrezzature molto specializzate e protocolli costosi, ma richiede un'enorme quantità di dati. Dati questi requisiti, la ricerca genomica è stata tradizionalmente riservata a laboratori istituzionali in grado di generare set di dati sufficientemente ampi per scoprire preziose intuizioni genomiche. Questo modello ha fornito un enorme valore alla comunità scientifica, ma spesso si traduce in set di dati isolati, custoditi dietro processi burocratici che ostacolano l'accesso del pubblico e la scienza dei cittadini. Data la democratizzazione del sequenziamento del DNA e di altre tecnologie omiche, come potremmo attingere alla scienza dei cittadini per catalizzare la ricerca e la conservazione su scala globale?

Sfide con la ricerca enteogenica: gli enteogeni sono stati custoditi per secoli da culture di tutto il mondo. I popoli Mazatec in Messico hanno amministrato l'uso dei funghi Psilocybe, gli Shipibo, i Noke Koi e numerose altre tribù dell'Amazzonia hanno custodito le tradizioni dell'Ayahuasca, i Wixarika e altri gruppi di nativi americani hanno protetto l'uso dell'Hikuri. Molte di queste comunità rischiano l'incarcerazione o addirittura la morte, poiché non solo questi sacramenti erano proibiti durante il periodo coloniale (almeno nella Nuova Spagna ), ma più recentemente sono caduti in un territorio pericoloso data la guerra alla droga. Oggi, invece, il fiorente rinascimento psichedelico,ispirato da studi clinici promettenti, guidato da una crisi globale della salute mentale e alimentato da un afflusso di finanziamenti privati, presenta un percorso verso l'accettazione di questi sacramenti all'interno della scienza moderna e dei quadri normativi. Sfortunatamente, crea anche incentivi perversi per l'appropriazione di risorse biologiche e conoscenze etnobotaniche (non guardare oltre le domande di brevetto di Compass Pathways nel territorio messicano). Come potremmo sviluppare quadri di collaborazione che consentano un accesso diffuso alla medicina enteogenica, garantendo al tempo stesso la reciprocità con i custodi della conoscenza e i loro ecosistemi bioculturali?

Un percorso in avanti: The Entheogen Data Commons

Data l'urgenza di proteggere sia gli ecosistemi di fronte al cambiamento climatico, sia i custodi della conoscenza da pratiche commerciali di sfruttamento, proponiamo con la presente lo sviluppo di uno stack tecnologico web3, compresa la creazione di due nuovi token non fungibili (NFT), vale a dire il IRB-NFT e Nagoya-NFT. L'obiettivo di questo stack tecnologico è consentire a una comunità decentralizzata di cittadini scienziati di partecipare agli sforzi di conservazione, fornire un quadro solido per una reciprocità giusta ed equa con i custodi della conoscenza e offrire nuovi mezzi per finanziare iniziative di conservazione in tutto il mondo.

In termini pratici, l'Entheogen Data Commons deve realizzare quanto segue:

  1. BioAsset Vouching : il primo passo consiste nel generare un record immutabile dell'impronta genetica di un organismo, la posizione di origine, il numero di accesso alla biobanca e qualsiasi record associato alla sua raccolta (secondo i requisiti del protocollo di Nagoya). Questo bioasset tokenizzato, molto probabilmente attraverso il framework Bio-NFT di Genobank, è progettato per diventare l'equivalente moderno di un buono da un giardino botanico o da un fungarium. Ciascuno di questi token sarà a sua volta collegato a vari file di dati grezzi ed elaborati come genomi, profili chimici, microbiomi, fenomi e informazioni etnobotaniche.
  2. Armonizzazione dei dati decentralizzata : nel tentativo di creare un set di dati scalabile e interoperabile sufficientemente ampio da fornire preziose informazioni biologiche, tutti i dati omici verranno eseguiti attraverso pipeline bioinformatiche armonizzate basate su browser (come QC, assemblaggio e annotazione), prima di bloccandolo su IPFS per l'archiviazione a lungo termine. Parallelamente a IPFS, testeremo la funzionalità di compostaggio dei dati di Arweave per l'arricchimento continuo dei set di dati *ad esempio aggiungendo annotazioni migliorate o dati omici aggiuntivi nel tempo.
  3. Migliore condivisione dei benefici : una caratteristica chiave dei Data Commons proposti è fornire trasparenza e tracciabilità senza precedenti agli accordi di condivisione dei benefici con le comunità di origine. Per fare ciò, proponiamo l'uso di un IRB-NFT - un token multi-sig ERC1155 per le approvazioni dell'Institutional Review Board - così come la creazione del Nagoya-NFT - un token ERC-4907 per vantaggi immutabili e a prova di manomissione. contratti di condivisione che consentono l'utilizzo condizionato dei dati senza il trasferimento della proprietà. Riteniamo che il Nagoya-NFT sia una componente cruciale per un ecosistema di ricerca giusto ed equo.
  4. Finanziamento basato sulla comunità: le donazioni verranno ricevute on-chain tramite EntheomeFoundation.eth o off-chain tramite la nostra entità senza scopo di lucro 501c3 negli Stati Uniti. Crediamo nel mantenere le cose semplici e quindi non concediamo alcun diritto economico o di governance ai donatori. Tuttavia, concediamo un certificato di donazione e altri vantaggi divertenti.

Sebbene la Entheome Foundation sia un custode/amministratore di dati a favore della scienza aperta, è evidente che i dati ospitati in Entheogen Data Commons saranno di notevole interesse sia per le entità accademiche che per quelle private. Proponiamo quindi un portale web per l'accesso biforcuto ai dati, in base al quale tutti gli usi non commerciali, come la scienza accademica o dei cittadini, avranno accesso accettando una licenza CBE permissiva simile ai ben noti framework di scienza aperta. Al contrario, le entità commerciali saranno tenute a presentare un protocollo di ricerca per l'approvazione da parte di un Institutional Review Board (IRB) indipendente. Se approvato, il comitato IRB creerà un Nagoya-NFT che delinea un accordo di ripartizione dei benefici giusto ed equo tra l'entità commerciale e le comunità di origine e concederà un IRB-NFT come prova di approvazione.

Prossimi passi e ringraziamenti

Resta sintonizzato per il nostro prossimo programma pilota con la comunità Mazatec, dove testeremo il framework Nagoya-NFT insieme ai custodi della conoscenza e alla comunità scientifica.

Grazie a Daniel Uribe di Genobank.io, Adam Goyer, Niklas Rindtorff di LabDAO, Michael Fischer di DBDAO e la community di PsyDao per il vostro feedback.

PS - The Entheogen Data Commons è un'iniziativa indipendente guidata dalla Entheome Foundation in collaborazione con una serie di partner tecnologici. Non vediamo l'ora di collaborare con la comunità scientifica decentralizzata per espandere questa visione. Per qualsiasi domanda o commento, si prega di contattare [email protected]