Les hérissons à blâmer pour un SARM Superbug, pas les antibiotiques modernes, suggère une étude

Les origines d'une super bactérie notoire remontent aux hérissons qui vivaient il y a des siècles, selon de nouvelles recherches cette semaine. L'étude a trouvé des preuves qu'un type particulier de Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline , également connu sous le nom de SARM, est apparu pour la première fois sur la peau des hérissons. Les bactéries ont probablement développé une résistance en réponse à des champignons vivant également sur des hérissons qui produisaient naturellement des composés antibiotiques pour tuer leurs concurrents, bien avant que les humains ne commencent à utiliser des antibiotiques pour traiter ces infections.
Le SARM est l'un des exemples les plus connus de résistance aux antibiotiques. Le terme fait référence à toutes les souches de S. aureus résistantes aux antibiotiques bêta-lactamines, une classe d'antibiotiques qui comprend la méthicilline mais aussi de nombreux autres médicaments, dont la pénicilline. Les souches de S. aureus , y compris le SARM, vivent naturellement sur notre peau et ailleurs, généralement sans causer de problèmes. Mais lorsque ces bactéries causent des maladies, souvent chez les personnes hospitalisées ou en moins bonne santé, les infections à SARM peuvent être beaucoup plus difficiles à éliminer avec les traitements conventionnels et peuvent devenir mortelles.
Les scientifiques ont découvert l'existence du SARM presque immédiatement après que la méthicilline soit devenue le médicament standard de choix pour les infections à staphylocoques dans les années 1960. Mais ce n'est que dans les années 1990 que le SARM est devenu largement connu, alors que les taux de cas liés aux hôpitaux ont grimpé et que des souches se propageant entre les personnes à l'extérieur des hôpitaux ont commencé à émerger. Depuis lors, des progrès ont été accomplis pour endiguer la vague de SARM dans les hôpitaux, bien que ces progrès aient pu ralentir ces dernières années. Les Centers for Disease Control and Prevention estiment que près de 120 000 Américains ont contracté de graves infections sanguines à SARM en 2017, tandis que près de 20 000 en sont décédés.
L'utilisation généralisée des antibiotiques en médecine et en agriculture depuis les années 1940 a favorisé l'émergence d'infections résistantes aux médicaments, dont le SARM. Mais il y a quelques années, des scientifiques ont fait une curieuse découverte : les hérissons vivant en Suède et dans d'autres pays européens semblaient largement porteurs d'une forme de SARM connue sous le nom de mecC-MRSA. On pense que le mecC-MRSA ne cause qu'une petite partie des infections à SARM chez l'homme, et bien que d'autres animaux en soient porteurs, les taux de colonisation étaient beaucoup plus élevés chez ces hérissons (environ les deux tiers l'avaient). Cela a conduit les scientifiques de l'époque à émettre l'hypothèse que les hérissons étaient un hôte naturel du mecC-MRSA depuis au moins des décennies.
Cette nouvelle recherche, publiée mercredi dans Nature, a trouvé des preuves génétiques que cette chronologie remonte beaucoup plus loin. Un groupe international de chercheurs du Royaume-Uni, du Danemark, de Suède et d'ailleurs, dont certains des premiers à documenter le mecC-MRSA chez les hérissons et d'autres animaux, a collaboré à l'étude. Ils ont séquencé les génomes de souches de SARM hérisson et les ont comparés à d'autres souches de S. aureus afin de construire un arbre généalogique probable.
Aussi proche qu'ils puissent le dire, les lignées qui ont donné naissance au SARM lié au hérisson que nous voyons aujourd'hui ont commencé au 19ème siècle, il y a environ 200 ans. L'équipe a également découvert qu'un champignon commun vivant sur la peau du hérisson, connu sous le nom de Trichophyton erinacei , peut produire deux types différents d'antibiotiques bêta-lactamines. Et en laboratoire, les souches de SARM hérisson semblaient mieux capables de survivre contre ces antibiotiques que les autres souches.
Tout compte fait, les résultats brossent un tableau aussi vieux que le temps.
« Notre étude suggère que ce n'était pas l'utilisation de la pénicilline qui a conduit à l'émergence initiale du SARM, c'était un processus biologique naturel. Nous pensons que le SARM a évolué dans une bataille pour la survie sur la peau des hérissons, et s'est ensuite propagé au bétail et aux humains par contact direct », a déclaré l'auteur principal de l'étude Ewan Harrison, chercheur au Wellcome Sanger Institute et à l'Université de Cambridge et auteur principal. de l'étude, dans un communiqué de Cambridge.
Les infections à mecC-MRSA chez l'homme sont rares et sont généralement bénignes et faciles à traiter avec d'autres antibiotiques lorsqu'elles surviennent. Ainsi, même si ces bactéries nous ont parfois rendus malades au cours des 200 dernières années, les résultats ne devraient pas nous faire craindre de traîner avec des hérissons, disent les auteurs.
Mais ils illustrent que le monde est un endroit plus petit et plus connecté que nous ne le pensons. Étant donné que la plupart des antibiotiques que nous utilisons aujourd'hui sont dérivés de sources naturelles, ce n'est peut-être pas le seul exemple de résistance importante aux antibiotiques qui existait avant l'ère des antibiotiques en médecine. Et nous savons déjà que la résistance aux antibiotiques trouvée chez d'autres animaux peut avoir de graves conséquences sur la santé des humains. Cela dit, alors que certains animaux peuvent héberger leurs propres superbactéries indigènes, notre surutilisation continue d'antibiotiques dans le bétail joue également un rôle majeur, voire principal, dans l'apparition de cette résistance.
"Ces résultats soulignent l'importance d'adopter une large perspective One Health sur la résistance aux antibiotiques qui reconnaît le rôle de la sélection naturelle chez les animaux sauvages et la connectivité des écosystèmes naturels, agricoles et humains dans l'évolution et la propagation des agents pathogènes résistants aux antibiotiques", ont déclaré les chercheurs. écrit.