Interroga CSV direttamente con DuckDB
Ti è stato affidato uno dei seguenti compiti:
— caricare un nuovo file csv in BigQuery per l'analisi
— aggiungere un nuovo file alla tua pipeline di dati
— eseguire alcuni leggeri controlli sulla qualità dei dati su un file-drop di un fornitore
Raggiungi gli strumenti più vicini e familiari a te noti. Di solito è caricare tutto in Excel, giusto? Che ti fa andare avanti. Ma il file è lungo 600 MB e oltre 1,2 milioni di righe. Excel ti dice che può caricare il file solo parzialmente.
Ok, quindi cosa succederà dopo?
Potresti essere su GCP/BigQuery, quindi fai il clicky-and-droppy ma BQ ti dice che la posizione 1023845 non va bene. Come fai a trovare quella posizione di byte in un file? <sospiro>
Cerchi StackOverflow e ti dicono di usare i panda. Ti porta fino in fondo, ma la tua velocità è ostacolata perché hai dimenticato ogni comando. Forse usi ChatGPT, ma hai bisogno di risposte subito e ne hai bisogno velocemente.
Non sarebbe bello semplicemente `selezionare * da output.csv`?
Beh, puoi assolutamente.
Passo 1
brew install duckdb
> duckdb
D> select * from ‘output.csv*’
Puoi anche fare `data/*.csv`, o anche altre estensioni come `data/*.parquet`.
Risoluzione dei problemi
Quindi il caricamento csv non sta andando così bene. Hai iniziato con duckdb, dice
Error: Invalid Input Error: Could not convert string ‘Column_1’ to INT32
in column “Column_1”, at line 100002.
La prima cosa che dovremmo fare è creare una vista sopra il tuo csv con alcuni numeri di riga in modo da poter iniziare a verificare il file e fare alcuni controlli di qualità leggeri.
create sequence seq_id start 1;
D> create or replace view test_1 as SELECT nextval(‘seq_id’) as seq_id, *
from read_csv(‘output.csv’, ALL_VARCHAR=1, AUTO_DETECT=TRUE);
couple of things here, of reference is https://duckdb.org/docs/data/csv
- Hai dei dati errati. Duckdb campiona ogni 100 righe e indovina il tipo di colonna. Alcuni dati nella tua colonna non sono come dovrebbero essere. `ALL_VARCHAR` ti consente di caricare tutto, indipendentemente dal tipo per l'analisi
— `AUTO_DETECT` significa usare la prima riga, indovina quante colonne dovrebbero esistere. Altrimenti dovremmo digitarli manualmente, `columns={'Column_1,', 'Column_2…}'`
A questo punto, poiché la nostra sequenza conta sempre, è un buon momento per bloccarla e materializzare la vista con i nostri numeri di riga.
create table test_1_mv as (select * from test_1);
— it seems that line numbers in errors are zero-indexed
— however you cannot start a sequence from 0
— so we need to subtract `1` from the id
select * from test_1 where seq_id = 100001
┌────────┬───────────────┬──────────────┬──┐
│ seq_id │ Column_1 │ Column_2 │ │
│ int64 │ varchar │ varchar │ │
├────────┼───────────────┼──────────────┼──┤
│ 100001 │ Column_1_text │ Column_2_text│ │
├────────┴───────────────┴──────────────┴──┤
│ 1 rows │
└──────────────────────────────────────────┘
Troviamo tutte le righe incriminate. Il mio primo pensiero è cercare tutte le righe che contengono `Column_1_text`.
select * from test_1 where column_1 = ‘Column_1_text’;
select * from test_1
where regexp_matches(Column_1, ‘[a-zA-Z]’)
delete from test_1_mv where seq_id in (select seq_id from test_1_mv
where regexp_matches(Column_1, ‘[a-zA-Z]’));
Scrivere il nuovo file — Esporta
Per esportare i dati da una tabella in un file CSV, utilizzare l'istruzione `COPY`.
COPY test_1_mv TO ‘output_cleaned.csv’ (HEADER, DELIMITER ‘,’);

![Che cos'è un elenco collegato, comunque? [Parte 1]](https://post.nghiatu.com/assets/images/m/max/724/1*Xokk6XOjWyIGCBujkJsCzQ.jpeg)



































