2022 年のまとめ

2022年は私にとってほろ苦い年でした。

私たちは、物理学に基づいた、ML で強化された計算創薬プラットフォームの継続的な開発において、大きな進歩を遂げました。最先端の精度と包括的な化学範囲を備えた次世代の力場エンジンを構築し、比類のないスループット、堅牢性、および精度を備えた堅牢で適応性のある結合自由エネルギー予測プログラムを再設計しました。生物物理学の実験データを高度な分子動力学シミュレーションに統合して、タンパク質の構造とダイナミクスの現実的なモデルを構築するための新しい方法、およびモダリティ固有のアプリケーションの方法とモデルを構築して、標的タンパク質分解物の構造およびダイナミクスに基づく合理的な設計を可能にし、共有結合阻害剤の発見を支援します。

さらに重要なことは、これらの計算ツールをうまく適用して、実際の創薬を可能にし、劇的に加速することです。たとえば、シミュレーションでモデル化された、以前は観測されていなかったが、その後結晶学で確認された三元複合体構造に基づいて新しい活性な分解剤を設計し、新しい二機能性分子を使用し、価値は高いが挑戦的な腫瘍学標的に対して活性阻害剤設計の割合を 5 倍に高めます。

私たちは、計算プラットフォームの基礎となる科学を報告する多くの論文を発表しました。

• ペアワイズ差の最適測定ネットワークを使用した複数分子の正確な結合自由エネルギー計算
• 分子動力学シミュレーションと構造質量分析の統合による、標的タンパク質分解の構造基盤の予測
• 三元複合体形成における協同性の影響とヘテロ二官能性分解剤によって媒介される標的タンパク質分解のモデル化
• インフルエンザヘマグルチニンのヒト適応につながる突然変異を予測するための受容体の柔軟性の特徴付け
• 創薬における結合自由エネルギー計算のゆっくりとした着実な上昇

今年の苦い部分は、創薬に対する同じ情熱を共有する、才能があり献身的な多くの同僚と別れたことです。お友達の皆さん、お元気で！

私は今、新たな機会の年を楽しみにしています。独立した、計算に焦点を当てたグループとして (このブログ投稿で考えたように)、Silicon Therapeutics と Roivant Discovery の創薬を強化したプラットフォームを、幅広い創薬コミュニティのより多くの創薬プロジェクトにもたらし、プラットフォームの価値を高め、患者により多くの医薬品をより迅速に発見するのに役立ちます。ご期待ください。

明けましておめでとうございます。研究をよろしくお願いします。