Mezunları kutlamak

Nov 25 2022
Hiçbir şey - kesinlikle hiçbir şey - kariyerinin başındaki bir araştırmacının parlak bir bilim insanına ve lidere dönüşmesini görmek gibisi yok. Bu hafta laboratuvar mezunlarımızın başarılarına odaklandık.

Hiçbir şey - kesinlikle hiçbir şey - kariyerinin başındaki bir araştırmacının parlak bir bilim insanına ve lidere dönüşmesini görmek gibisi yok. Bu hafta laboratuvar mezunlarımızın başarılarına odaklandık.

Şu şekilde alıntı yapın: Kamoun, S. (2022). Mezunları kutluyoruz.Zenodo https://doi.org/10.5281/zenodo.7358976

21 Kasım 2022'nin bu yağışlı ve soğuk haftasında, mezunlarla ilgili bir dizi karşılaşma ve etkinlik, eski dostlar ve meslektaşlarla bir araya gelmenin iç açıcı hissine odaklanmayı getirdi. Hiçbir şey - kesinlikle hiçbir şey - kariyerinin başındaki bir araştırmacının parlak bir bilim insanına ve lidere dönüşmesini görmek gibisi yok. Bunlar onların hikayeleri.

Oxford avcıları

Oxford Üniversitesi'nden meslektaşım Renier van der Hoorn'un laboratuvarı, bitki hidrolazlarının patojen inhibitörleriyle birlikte evrimsel bir silahlanma yarışına nasıl yakalandığı konusunda araştırmalara öncülük etti ve böylece apoplastik bağışıklığın önemini tanımlamaya yardımcı oldu. Yeni patojen inhibitörleri arayışı devam ediyor. Tee ve Jie, Renier'in hidrolaz inhibitörü avcıları ekibi arasında kilit rol oynuyor . Pazartesi günü, çalışmalarını takip etmek için Renier'in laboratuvarına uğradım ve diğerlerinin yanı sıra Tee ve Jie ile tanıştım.

Tee Nattapong , John Innes Center ve The Sainsbury Laboratuvarı (TSL) tarafından ortaklaşa düzenlenen bir program olan Uluslararası Lisans Yaz Okulu'nun bir parçası olarak Temmuz 2014'te laboratuvara katıldı . Halihazırda Rothamsted Research'te çalışan, laboratuvarda deneyimli bir bilim insanı olan Vladimir Nekrasov ile yakın bir şekilde çalıştı .

2014 yaz dönemi lisans öğrencilerimiz: Imperial College aracılığıyla Tayland'dan Nattapong (Tee) Sanguankiattichai ve İzmir Teknoloji Enstitüsü'nden Egem Ozbudak, Türkiye. Nattapong, Vladimir Nekrasov ve Egem, Yasin Dağdaş ile çalışıyor.

Tee, Imperial College'da yüksek lisans yapmaya devam etti , araştırma yaptı ve başka bir laboratuvar mezunu Tolga Bozkurt ile patojen efektörleri üzerine bir çalışmaya katkıda bulundu , ardından Gail Preston ile doktorası ve Renier ile şu an doktora sonrası çalışması için Oxford'a taşındı. Bakterilerin bitkiler tarafından tespit edilen flagellin'in üstesinden nasıl geldiğine dair Tee'nin son gözden geçirme makalesine göz atın .

Jie Huang , laboratuvarımıza bağlı Oxford avcılarının bir başka üyesidir. Jie, Oxford'a taşınmadan önce Nanjing Ziraat Üniversitesi'nde (NJAU) laboratuvar mezunu Suomeng Dong ile çalıştı. Jie, NJAU'da bitki öldürücü Phytophthora'nın efektörleri hakkında bir dizi makale yayınladı ve en son patojenin konakçı mRNA'nın alternatif eklenmesini modüle ettiğini gösterdi .

Euro Kazananlar

Avrupa Araştırma Konseyi (ERC) hibeleri, tüm kariyer aşamalarındaki bilim insanlarına 5 yıllık cömert bir finansman sağlar. ERC Başlangıç ​​hibeleri, doktora sonrası 7 yıldan az deneyime sahip adaylara sunulmaktadır. Bu hibeler, riskli ve keşfedici araştırmalara olanak sağlayan istikrarlı finansman sağlayarak Erken Kariyer Araştırmacılarının (ECR'ler) çalışmalarını hızlandırabilir - tam da ECR'lerin yapmaya teşvik edilmesi gereken şey. Salı, bir Sainsbury Laboratuvarı bilim adamı olan Thorsten Langner ile iki mezun, Miriam Oses-Ruiz ve Annis Richardson'ın en son 2022 finansman turunda #ERCStg aldığı harika haberi getirdi .

The Sainsbury Lab web sitesinde görüldüğü gibi , haber sadece başarılı başvuru sahipleri tarafından değil, aynı zamanda meslektaşları tarafından da coşkulu kutlamalarla sonuçlandı:

“ Laboratuvarın hazırlıksız çifte kutlamasındaki heyecanlı enerjiden, TSL üyelerinin erken kariyer araştırmacılarının başarılarını bizim en gurur verici başarılarımız olarak gördükleri açıktı. İleriye dönük bir enstitü olarak, sürdürülebilir bir gelecek için en büyük etkimizin bitki biliminde liderler yetiştirmek olacağına inanıyoruz. ”

Gerçekten de, ECR'lerimizin başarısına tanık olmaktan daha fazla keyif veren başka ne var?

Thorsten ve Miriam, her ikisi de Magnaporthe oryzae olarak bilinen korkunç patlama mantarının biyolojisi ve patolojisi üzerinde çalışan Usta Püskürtücülerdir . Thorsten projesi, Güneydoğu Asya ve Afrika'da buğday üzerinde tahribata neden olan bu mantarın pandemik bir türüne odaklanıyor . Thorsten'in yazdığı gibi, " konakçının zayıf noktalarını bir savunma stratejisine dönüştürerek, salgın buğday patlaması mantarına karşı buğday bağışıklık reseptörleri tasarlamayı " planlıyor .

Thorsten Langner'ın buğday patlama mantarı üzerine PANDEMİ projesi.

Thorsten, mantarın mini kromozom olarak bilinen genomunun dış kısmında taşıdığı virülans efektör genlerine odaklanarak hedeflerine ulaşmayı hedefliyor.

Son yıllarda Thorsten, bu önceki gönderide tartışıldığı gibi açık bilimi ve ön baskıyı benimsedi . Örneğin, mini kromozomlarla ilgili ana makalesinden önce, PLOS Pathogens dergisinde resmi olarak yayınlanmadan önce toplulukla paylaştığı yöntem ve veri seti mini makaleleri vardı. Açık bilimi benimsemesi, ERC panelistleri tarafından karar özetinde şu şekilde not edildi: “ Başvuranın baskı öncesi yayın ve açık veri paylaşımı taahhüdü özellikle övgüye değerdir. ” Thorsten'a teşekkürler. Belki de bu örnek, hakemleri ve panelistleri çalışmanızın değeri ve etkisi konusunda ikna etmenin belirli dergilerde yayınlamaktan daha fazlasını gerektirdiğini gösteriyor.

Gelecekteki gelişmelere kısa bir bakış — Finans kuruluşları, başvuranın açık bilime olan bağlılığını giderek daha fazla değerlendiriyor.

Miriam şu anda İspanya'daki Navarra Üniversitesi'nde Ramon y Cajal Araştırma Görevlisidir. Doktorasını yaptı. TSL İcra Direktörü görevini üstlendiğinde Norwich'e katılmadan önce , patlama mantarı büyücüsü Nick Talbot'un Exeter Üniversitesi laboratuvarında . Ancak Miriam'ın TSL ile bağlantısı doktorasının öncesine dayanmaktadır. 2008 yılında grubumuzda Joe Win ile moleküler bitki patolojisi projelerinde ön doktora yaptı. Miriam'dan ilham alın gençler! Doktoranıza başlamadan önce bir predoc yapın .

Stajını tamamladıktan sonra İspanya'nın Pamplona kentine dönen Miriam Oses-Ruiz'e veda. [15 Ekim 2008]

Miriam "düşmanı tanımak" istiyor . Patlama mantarındaki hücresel heterojenlik sürecini anlamayı ve bunun patojenin bitkileri enfekte etme kapasitesiyle nasıl bağlantılı olduğunu belirlemeyi amaçlıyor. Bunu , bitki yüzeyini parçalamak ve bitki dokusuna nüfuz etmek için büyük fiziksel güç üreten , appressoria olarak bilinen mantar yapılarını inceleyerek yapacak.

Miriam ve apressoria.

Annis, Edinburgh Üniversitesi Moleküler Bitki Bilimleri Enstitüsü'nde Bitki Şekli Laboratuvarı'nı yönetiyor . Laboratuvar, yaprakların ve çiçeklerin şeklini nasıl aldıklarını anlamayı amaçlıyor, bu araştırma programı kesinlikle ERC fonuyla desteklenecek.

10 yılı aşkın bir süre önce, kendini bitki geliştirmeye adamadan önce, Annis, birkaç yıl sonra Kantitatif Bağışıklığı yürütürken kendi ERC hibesini almaya devam eden ekibimizin kıdemli bir üyesi olan Sylvain Raffaele ile doktora rotasyonu için Laboratuvarımıza katıldı. Fransa'daki INRAe'de Bitkiler (QIP) Laboratuvarı .

Laboratuvarda kısa süre kalmasına rağmen Annis, Sylvain, Tolga ve diğerlerinin o sırada İrlanda patates kıtlığı patojeni Phytophthora infestans'ın bitkilere bulaşmayı tercih ettiği konakçı hücresel süreçleri belirleme konusunda yaptıkları çalışmaya önemli katkılarda bulundu . Bu, Annis'in Plant Physiology dergisinin kapağında yer alan bir makalenin ortak yazarlığıyla sonuçlandı .

Bozkurt, Richardson ve ark. bitki dokusunu istila eden güçlü patates geç yanıklık patojenini gösteren kapak.

Rosalind Franklin Ödüllü

Salı akşamı, birçoğumuz Diane Saunders'ın "bir mısır gevreği katilini nasıl zekamızla alt edebiliriz" konferansına katılmak için Londra'daki Royal Society'ye gittik . Diane, John Innes Merkezi'nde bir bitki patoloğu. Royal Society tarafından yalnızca olağanüstü araştırmasıyla değil - başka bir ERC ödülü sahibi - aynı zamanda ECR'lerin kariyerlerine ilham vermek ve ilerlemelerine yardımcı olmak için bir araya getirdiği #WomeninWheat programıyla da tanındı.

Diane, Ocak 2010'da Nick Talbot ile - o zamanlar Exeter Üniversitesi'nde - patlama mantarı üzerinde çalışarak doktorasını tamamladıktan sonra Kamoun Laboratuvarı'na katıldı. Hepimiz bir dereceye kadar birbirimize bağlıyız. Akademik ağ, mantar hiflerinden oluşan bir ağ kadar birbirine bağlıdır.

[3 Ocak 2010] Yeni laboratuvar üyesi: Diane Saunders, daha önce Exeter Üniversitesi'nden Nick Talbot ile doktora öğrencisiydi.

Diane'in Royal Society'deki dersi, bir bilim iletişimi ustalık sınıfıydı. Onunki, başarılı bir bilim adamı olmanın belirli dergilerdeki makaleleri kovalamaktan daha fazlasını gerektirdiğinin bir başka örneği. Diane'in bilim kurgu sevgisinin izini, 2012'de TSL'deyken başlayan kül geri dönüşü salgınında yaptığı işe kadar sürebilirim. O zamanlar, şimdi Kyoto Üniversitesi'nde olan Kentaro Yoshida ve TSL'nin kendi üyesi Dan MacLean ile birlikte çalışan Diane, açık bilim ve hızlı genom dizilemenin bitki sağlığı acil durumlarına uygulanmasına öncülük etti - buğday pası hastalıklarına uygulamaya devam ettiği bir yaklaşım ve mevcut buğday patlaması salgınını araştırmak için kullandığımız .

Diane Saunders, burada arka planda Kentaro Yoshida, Anne Edwards ve Dan MacLean ile OpenAshDieback projesini sergiliyor.

Ne haftası ha?

Tenten'in ünlü mem'i "Kaptan, bugün Çarşamba" diyor . Paylaşılacak daha birçok şap hikayesi var. Bunlardan bazıları bu Twitter araması aracılığıyla bulunabilir .

teşekkürler

Bu gönderi, geçmiş ve şimdiki tüm laboratuvar üyelerine ayrılmıştır. Bilim tutkunuzu paylaştığınız ve yaydığınız için teşekkür ederiz.