Dernières données scientifiques sur Omicron : efficacité du vaccin, comment il se multiplie, et plus encore

Dec 17 2021
Un travailleur de la santé prépare une injection du vaccin de rappel Moderna. La pandémie de covid-19 resurgit à nouveau aux États-Unis.
Un travailleur de la santé prépare une injection du vaccin de rappel Moderna.

La pandémie de covid-19 refait surface aux États-Unis et ailleurs, et bien que nous ayons maintenant beaucoup plus d'outils disponibles contre la maladie virale que nous n'en avions l'hiver dernier, à savoir une armada complète de vaccins préventifs et de traitements qui feront bientôt leurs débuts . l'émergence de la variante Omicron autour de Thanksgiving a jeté une clé dans les travaux. Même si Omicron n'était pas entré en scène, les États-Unis seraient toujours confrontés à une augmentation des cas, des décès et des hospitalisations liés au covid-19.

Vous trouverez ci-dessous un résumé de certaines des dernières recherches sur Omicron et ses risques. Il est important de noter que bon nombre de ces études sont encore préliminaires et n'ont peut-être pas encore fait l'objet d'un examen par les pairs, de sorte que leurs conclusions doivent être considérées avec une prudence accrue. Il faut du temps et une base de preuves pour être sûr de quoi que ce soit.

Omicron a déconcerté les scientifiques en raison de son mélange unique de mutations qui semblent le faire ressembler et se comporter différemment du coronavirus d'origine, ainsi que des variantes antérieures. Il est théorisé que ces mutations pourraient permettre au virus de se transmettre plus facilement entre les personnes et de mieux échapper au système immunitaire des personnes qui ont été vaccinées ou infectées dans le passé. Et nous commençons maintenant à voir des données soutenir ces théories.

Cette semaine, une étude préliminaire en laboratoire menée par des chercheurs de Hong Kong a révélé qu'Omicron peut infecter et se multiplier à l'intérieur des cellules de nos bronches (les deux tubes qui transportent l'air de la trachée aux poumons) beaucoup plus rapidement que la variante Delta - jusqu'à 70 fois plus vite. Cette vitesse vorace pourrait expliquer pourquoi les cas d'Omicron dans le monde réel semblent se propager beaucoup plus rapidement que l'épidémie de covid standard, même parmi les populations principalement vaccinées.

Mais il peut y avoir une doublure argentée ici : la même étude a révélé qu'Omicron ne se reproduisait pas aussi vite que Delta dans les cellules du poumon. Cela pourrait peut-être expliquer pourquoi certaines données suggèrent qu'Omicron provoque une maladie plus bénigne que les variantes passées. Mais la maladie liée au covid est un processus compliqué, qui ne concerne pas seulement le comportement du virus, mais aussi la réponse de notre réponse immunitaire. Parce que tant de personnes ont été vaccinées ou déjà infectées, il est encore trop tôt pour dire si Omicron est intrinsèquement plus doux ou simplement arrêté par ces systèmes immunitaires entraînés avant qu'il ne cause trop de problèmes.

En parlant d'immunité, il continue d'y avoir de bonnes et de mauvaises nouvelles sur ce front.

Un article préimprimé sur BioRXiv cette semaine, par exemple, a comparé la façon dont la variante Omicron a répondu aux anticorps collectés auprès de personnes précédemment infectées et celles ayant reçu divers vaccins – non seulement les deux vaccins à ARNm de Moderna et Pfizer / BioNTech, mais le vaccin AstraZeneca, le Johnson & Johnson abattu, ainsi que des vaccins de Russie et de Chine. Dans l'ensemble, par rapport au virus d'origine et à la variante Alpha, les niveaux d'anticorps neutralisants (ceux qui aident à prévenir l'infection) ont considérablement diminué spécifiquement pour Omicron. Pour le vaccin Johnson & Johnson et le Spoutnik V russe, les niveaux ont chuté au point où une faible protection contre l'infection serait attendue.

Les résultats concordent avec d'autres preuves indiquant que les vaccins ne sont pas efficaces pour prévenir l'infection par Omicron. Des données récentes d'Afrique du Sud, où la variante a été découverte pour la première fois, ont estimé que l'efficacité du vaccin Pfizer pour arrêter l'infection est passée de 80% à 33% une fois qu'Omicron est devenu dominant.

Dans le même temps, les anticorps ne sont pas l'image complète de l'immunité. Des études publiées cette semaine ont suggéré que les cellules T – une autre ligne de défense clé contre les germes familiers – spécifiques au coronavirus restent robustes même face à Omicron, comme de nombreux scientifiques l'avaient prévu. On pense que ces cellules sont très importantes pour empêcher l'infection de provoquer une maladie grave. Et tandis que les scientifiques travaillent rapidement sur le développement d'un vaccin spécifique à Omicron, les injections de rappel basées sur le virus d'origine semblent fournir un tampon même là-bas. Une étude de Moderna cette semaine a révélé que les niveaux d'anticorps neutralisants remontaient considérablement après un troisième tir.

Les boosters valaient déjà la peine avant même qu'Omicron ne soit dans le mélange, mais ils semblent plus prudents à la minute.

L'un des nombreux mystères entourant Omicron est son origine. Il a été découvert pour la première fois en Afrique du Sud en novembre, mais ce n'est pas nécessairement là qu'il est originaire - l'impressionnante surveillance génétique du pays l'a peut-être repéré avant tout le monde.

Au-delà de la géographie, il y a aussi la question de sa lignée. Toutes les variantes préoccupantes à ce jour n'ont subi que de légères modifications de leur structure de base, mais Omicron a plus de 30 mutations dans sa seule protéine de pointe. Parce que les scientifiques suivent désormais constamment l'évolution du coronavirus en examinant périodiquement la génétique des échantillons de virus prélevés sur des patients, il serait très étrange qu'une variante capte autant de mutations sous notre nez sans préavis - et pourtant, c'est exactement ce qui semble s'être passé ici.

Actuellement, il existe deux théories majeures sur la naissance d'Omicron. La première est que la variante est apparue chez une personne immunodéprimée, où l'infection a pu persister et s'adapter à un système immunitaire affaibli beaucoup plus longtemps que d'habitude, permettant à certaines populations de coronavirus de survivre avec ces mutations et d'être ensuite transmises à quelqu'un d'autre. L'autre est qu'Omicron a muté alors qu'il se trouvait dans un hôte animal, puis est revenu aux humains. Un article préimprimé par des scientifiques en Chine cette semaine postule que l'ancêtre d'Omicron est passé de l'homme à la souris, puis à un moment donné plus tard, est revenu directement à l'homme, maintenant avec une nouvelle configuration génétique époustouflante.

Sur la base de leurs expériences en laboratoire, les chercheurs affirment que les mutations trouvées dans Omicron ne ressemblent pas beaucoup aux mutations que nous avons vues auparavant sur des virus hébergés par des humains, mais elles ressemblent à des mutations observées dans des souches collectées à partir de cellules hébergées par des souris. Les mutations d'Omicron ressemblent également un peu aux mutations qui peuvent permettre au virus de mieux infecter les cellules de souris, disent-ils.

« Collectivement, nos résultats suggèrent que l'ancêtre d'Omicron est passé des humains aux souris, a rapidement accumulé des mutations propices à l'infection de cet hôte, puis est revenu aux humains, indiquant une trajectoire évolutive inter-espèces pour l'épidémie d'Omicron », ont-ils écrit.

Ce ne sont pas les seuls scientifiques à théoriser une origine animale pour Omicron. Et c'est certainement plausible - les scientifiques s'inquiètent de ce type d'évolution depuis un certain temps maintenant, une fois qu'il est devenu évident que le coronavirus pouvait facilement passer des humains aux autres animaux. Ce n'est encore qu'un travail préliminaire, et d'autres recherches seront certainement menées à ce sujet. Pour le contexte, il y a encore deux ans de débats féroces sur les origines de la pandémie elle-même, de sorte que les réponses sur la source d'Omicron peuvent ne pas venir facilement non plus.

L'arrivée d'Omicron devrait nous rappeler que, dans la mesure où nous pouvons nous adapter au virus au fil du temps, le germe peut apprendre lui-même de nouvelles astuces.