Merayakan alumni

Nov 25 2022

Tidak ada - sama sekali tidak ada - yang mengalahkan melihat seorang peneliti karir awal berkembang menjadi ilmuwan dan pemimpin yang brilian. Minggu ini berfokus pada kesuksesan alumni lab kami.

Dikutip sebagai: Kamoun, S. (2022). Merayakan alumni. Zenodo https://doi.org/10.5281/zenodo.7358976

Di minggu yang basah dan dingin pada tanggal 21 November 2022 ini, serangkaian pertemuan dan acara terkait alumni memusatkan perasaan hangat saat bertemu dengan teman dan kolega lama. Tidak ada - sama sekali tidak ada - yang mengalahkan melihat seorang peneliti karir awal berkembang menjadi ilmuwan dan pemimpin yang brilian. Ini adalah kisah mereka.

Pemburu Oxford

Laboratorium kolega saya di Universitas Oxford, Renier van der Hoorn , telah memelopori studi tentang bagaimana hidrolase tanaman terjebak dalam perlombaan senjata koevolusioner dengan penghambat patogen, sehingga membantu menentukan pentingnya kekebalan apoplastik. Perburuan penghambat patogen baru terus berlanjut. Tee dan Jie adalah kunci di antara tim pemburu penghambat hidrolase Renier . Pada hari Senin, saya mampir ke lab Renier untuk mengejar pekerjaannya dan bertemu dengan Tee dan Jie di antara yang lainnya.

Tee Nattapong bergabung dengan lab pada Juli 2014 sebagai bagian dari International Undergraduate Summer School , sebuah program yang diselenggarakan bersama oleh John Innes Center dan The Sainsbury Laboratory (TSL). Dia bekerja sama dengan ilmuwan berpengalaman di lab Vladimir Nekrasov — saat ini di Rothamsted Research.

Siswa sarjana musim panas 2014 kami: Nattapong (Tee) Sanguankiattichai dari Thailand melalui Imperial College dan Egem Ozbudak, Institut Teknologi Izmir, Turki. Nattapong bekerja dengan Vladimir Nekrasov dan Egem dengan Yasin Dagdas.

Tee melanjutkan untuk mengambil gelar MSc di Imperial College , melakukan penelitian dan berkontribusi pada studi tentang efektor patogen dengan alumni lab lain Tolga Bozkurt , sebelum pindah ke Oxford untuk gelar PhD dengan Gail Preston dan postdoc saat ini dengan Renier. Lihat artikel review terbaru Tee tentang bagaimana bakteri mengatasi deteksi flagellin oleh tanaman .

Jie Huang adalah anggota lain dari pemburu Oxford yang terhubung dengan lab kami. Sebelum pindah ke Oxford, Jie bekerja dengan alumni lab Suomeng Dong di Nanjing Agricultural University (NJAU). Di NJAU, Jie menerbitkan sejumlah makalah tentang efektor pembunuh tanaman Phytophthora , baru-baru ini menunjukkan bahwa patogen memodulasi splicing alternatif mRNA inang .

Pemenang Euro

Hibah European Research Council (ERC) memberikan dana 5 tahun yang murah hati kepada para ilmuwan di semua tahap karir. Hibah Awal ERC ditawarkan kepada pelamar dengan pengalaman kurang dari 7 tahun setelah PhD mereka. Hibah ini dapat mempercepat pekerjaan Peneliti Karier Awal (ECR) dengan menyediakan pendanaan stabil yang memungkinkan penelitian yang berisiko dan eksplorasi — tepat seperti apa yang harus didorong oleh ECR. Selasa membawa kabar luar biasa bahwa seorang ilmuwan Sainsbury Lab, Thorsten Langner , dan dua alumninya, Miriam Oses-Ruiz dan Annis Richardson , menerima #ERCStg dalam putaran pendanaan terbaru tahun 2022 .

Seperti yang terlihat di situs web The Sainsbury Lab , berita tersebut menghasilkan perayaan yang meriah tidak hanya oleh pelamar yang berhasil, tetapi juga oleh kolega mereka:

“ Terlihat jelas dari energi yang bersemangat pada perayaan ganda dadakan di lab bahwa anggota TSL memandang kesuksesan peneliti karir awal sebagai pencapaian paling membanggakan kami. Sebagai institut berwawasan ke depan, kami percaya bahwa dampak terbesar kami untuk masa depan yang berkelanjutan adalah melalui pengembangan para pemimpin dalam ilmu tanaman. ”

Memang, apa lagi yang lebih menyenangkan selain menyaksikan kesuksesan ECR kami?

Thorsten dan Miriam adalah Master Blasters, keduanya mengerjakan aspek biologi dan patologi jamur ledakan menakutkan yang dikenal sebagai Magnaporthe oryzae . Proyek Thorsten berfokus pada jenis pandemi jamur ini, yang menyebabkan malapetaka pada gandum di Asia Tenggara dan Afrika . Seperti yang ditulis Thorsten, dia berencana untuk " merancang reseptor kekebalan gandum melawan jamur ledakan gandum pandemi dengan mengubah titik lemah inang menjadi strategi pertahanan ."

Proyek PANDEMI Thorsten Langner pada jamur ledakan gandum.

Thorsten bertujuan untuk mencapai tujuannya dengan berfokus pada gen efektor virulensi yang dibawa jamur pada bagian luar genomnya, yang dikenal sebagai kromosom mini.

Selama beberapa tahun terakhir, Thorsten telah menganut sains terbuka dan pracetak seperti yang dibahas dalam posting sebelumnya ini . Misalnya, makalah utamanya tentang kromosom mini didahului oleh makalah mini metode dan dataset yang ia bagikan dengan komunitas sebelum publikasi resmi di jurnal PLOS Pathogens. Pelukannya terhadap sains terbuka sepatutnya dicatat oleh panelis ERC saat mereka menulis dalam ringkasan keputusan, “ Komitmen pelamar untuk publikasi pracetak dan berbagi data secara terbuka sangat terpuji. ” Pujian Thorsten. Mungkin contoh ini menunjukkan bahwa dibutuhkan lebih dari sekadar menerbitkan di jurnal tertentu untuk meyakinkan pengulas dan panelis tentang nilai dan dampak karya Anda.

Sekilas hal-hal yang akan datang — Lembaga pendanaan semakin mengevaluasi dedikasi pelamar untuk ilmu pengetahuan terbuka.

Miriam saat ini adalah Ramon y Cajal Research Fellow di University of Navarra di Spanyol. Dia melakukan Ph.D. di lab penyihir ledakan jamur Universitas Exeter Nick Talbot sebelum bergabung dengannya ke Norwich ketika dia mengambil posisi Direktur Eksekutif TSL. Namun, koneksi Miriam ke TSL sudah ada sejak sebelum gelar PhD-nya. Pada tahun 2008, dia melakukan predoc dalam kelompok kami bekerja dengan Joe Win pada proyek patologi tanaman molekuler. Dapatkan inspirasi dari Miriam, anak muda! Lakukan predoc sebelum memulai PhD Anda .

Perpisahan dengan Miriam Oses-Ruiz yang kembali ke Pamplona, Spanyol, setelah menyelesaikan magangnya. [15 Oktober 2008]

Miriam ingin “mengenal musuh” . Dia bertujuan untuk memahami proses heterogenitas seluler pada jamur blast dan untuk menentukan bagaimana hubungannya dengan kapasitas patogen untuk menginfeksi tanaman. Dia akan melakukan ini dengan mempelajari struktur jamur yang dikenal sebagai appressoria yang menghasilkan kekuatan fisik yang sangat besar untuk menghancurkan permukaan tanaman dan menembus jaringan tanaman.

Miriam dan apresoria.

Annis berada di Institute of Molecular Plant Sciences di University of Edinburgh di mana dia menjalankan Plant Shape Lab . Lab bertujuan untuk memahami bagaimana bentuk daun dan bunga, sebuah program penelitian yang pasti akan didorong oleh pendanaan ERC.

Lebih dari 10 tahun yang lalu, sebelum dia mengabdikan diri pada pengembangan tanaman, Annis bergabung dengan Lab kami untuk rotasi PhD bersama Sylvain Raffaele , anggota senior tim kami yang beberapa tahun kemudian mendapatkan hibah ERC sendiri sambil menjalankan Imunitas Kuantitatif di Plants (QIP) Lab di INRAe di Prancis.

Meskipun tinggal sebentar di lab, Annis memberikan kontribusi penting untuk pekerjaan yang dilakukan Sylvain, Tolga, dan lainnya pada saat itu dalam mengidentifikasi proses seluler inang yang dikooptasi oleh patogen kelaparan kentang Irlandia Phytophthora infestans untuk menginfeksi tanaman. Hal ini mengakibatkan Annis ikut menulis makalah yang ditampilkan di sampul jurnal Plant Physiology .

Bozkurt, Richardson dkk. sampul menampilkan patogen busuk daun kentang yang kuat yang menyerang jaringan tanaman.

Penerima Penghargaan Rosalind Franklin

Pada Selasa malam, beberapa dari kami pergi ke Royal Society di London untuk menghadiri kuliah Diane Saunders , "bagaimana mengakali pembunuh sereal". Diane adalah ahli patologi tumbuhan di John Innes Center. Dia diakui oleh Royal Society tidak hanya untuk penelitiannya yang luar biasa — dia adalah penerima ERC lainnya — tetapi juga untuk program #WomeninWheat yang dia susun untuk menginspirasi dan membantu memajukan karier ECR.

Diane bergabung dengan Kamoun Lab pada Januari 2010 setelah menyelesaikan PhD-nya dengan Nick Talbot – saat itu di University of Exeter – mengerjakan jamur blast. Kita semua terhubung sampai taraf tertentu. Jaringan akademik saling berhubungan seperti jalinan hifa jamur.

[3 Januari 2010] Anggota lab baru: Diane Saunders, sebelumnya adalah mahasiswa PhD di Nick Talbot, University of Exeter.

Kuliah Diane di Royal Society adalah kelas master ilmu komunikasi. Miliknya adalah contoh lain bagaimana menjadi ilmuwan yang sukses membutuhkan lebih dari sekadar mengejar makalah di jurnal tertentu. Saya dapat melacak kembali kecintaan Diane pada scicom hingga pekerjaan yang dia lakukan pada wabah ash dieback mulai tahun 2012 ketika dia berada di TSL. Saat itu, bekerja dengan Kentaro Yoshida — sekarang di Universitas Kyoto — dan Dan MacLean milik TSL , Diane memelopori penerapan sains terbuka dan pengurutan genom cepat untuk keadaan darurat kesehatan tanaman — sebuah pendekatan yang kemudian dia terapkan pada penyakit karat gandum , dan yang kami gunakan untuk menyelidiki pandemi ledakan gandum saat ini .

Diane Saunders, di sini di latar belakang bersama Kentaro Yoshida, Anne Edwards dan bersama Dan MacLean menampilkan proyek OpenAshDieback.

Minggu apa, ya?

“Kapten, ini hari Rabu,” kata meme Tintin yang terkenal itu . Masih banyak lagi cerita alumni yang bisa dibagikan. Beberapa di antaranya dapat ditemukan melalui pencarian Twitter ini .