24 Kasım 2021'de Güney Afrika'daki araştırmacılar tarafından omicron (B.1.1.529) adlı yeni bir varyant bildirildi ve iki gün sonra Dünya Sağlık Örgütü tarafından "endişe verici bir varyant" olarak belirlendi . Omicron, COVID-19'a neden olan virüs olan SARS-CoV-2'nin bugüne kadarki en ağır mutasyona uğramış varyantı olduğu için çok sıra dışı .
Omicron varyantının toplamda 50 mutasyonu vardır ve yalnızca spike proteininde 32 mutasyon vardır. SARS-CoV-2 virüsünün dışında çıkıntılı yumrular oluşturan başak proteini, virüsün hücrelere yapışmasına yardımcı olur, böylece giriş kazanabilir. Aynı zamanda, şu anda ABD'de mevcut olan üç aşının da koruyucu antikorları indüklemek için kullandığı proteindir . Karşılaştırma için, delta varyantı dokuz mutasyona sahiptir. Omicron varyantındaki daha fazla sayıda mutasyon, daha bulaşıcı olabileceği ve/veya bağışıklık korumasından kaçınmada daha iyi olabileceği anlamına gelebilir - bu çok endişe verici bir olasılık.
Yeni salgın veya pandemik virüslerin nasıl ortaya çıktığını daha iyi anlamak için ortaya çıkan ve zoonotik virüsleri inceleyen bir virologum . Araştırma grubum, hayvanlara yayılması da dahil olmak üzere COVID-19 virüsünün çeşitli yönlerini araştırıyor.
Neden Yeni SARS-CoV-2 Varyantları Ortaya Çıkmaya Devam Ediyor?
Omicron varyantındaki olağandışı yüksek sayıda mutasyon şaşırtıcı olsa da, başka bir SARS-CoV-2 varyantının ortaya çıkması beklenmedik değil.
Doğal seçilim yoluyla, herhangi bir virüste rastgele mutasyonlar birikir. Bu süreç, SARS-CoV-2 dahil olmak üzere RNA virüslerinde hızlandırılır. Bir mutasyon seti, bir varyant için öncekilere göre bir hayatta kalma avantajı sağlıyorsa ve sağladığında, varyant, mevcut tüm diğer virüs varyantlarını geride bırakacaktır.
Omicron varyantının daha fazla sayıda mutasyonu, deltadan daha tehlikeli ve bulaşıcı olduğu anlamına mı geliyor? Henüz bilmiyoruz. Varyantın ortaya çıkmasına neden olan koşullar henüz net değil, ancak açık olan şey, omicron'daki mutasyonların sayısının ve konfigürasyonunun olağandışı olduğudur.
Birden fazla mutasyona sahip viral varyantların nasıl ortaya çıktığının olası bir açıklaması, bağışıklık sistemi baskılanmış bir hastada uzun süreli enfeksiyon yoluyla olabilir - bu, hızlı viral evrime yol açabilecek bir durumdur . Araştırmacılar, alfa varyantı gibi daha önceki SARS-CoV-2 varyantlarından bazılarının, kalıcı olarak enfekte olmuş bir hastadan kaynaklanmış olabileceğini varsaydılar. Bununla birlikte, omicron varyantındaki olağandışı takımyıldızı ve sayısız mutasyon, onu diğer tüm SARS-CoV-2 suşlarından çok farklı kılıyor ve bu da nasıl ortaya çıktığına dair soruları gündeme getiriyor.
Bir başka olası varyant kaynağı, hayvan konakçıları olabilir. COVID-19'a neden olan virüs; vizon, kaplan, aslan, kedi ve köpek gibi birçok hayvan türünü enfekte edebilir. Henüz hakemli olmayan bir çalışmada, yakın zamanda liderliğini yaptığım uluslararası bir ekip , ABD'de serbest yaşayan ve tutsak ak kuyruklu geyiklerde SARS-CoV-2'nin yaygın olarak bulaştığını bildirdi. omikron varyantı, hızlı evrim yoluyla bir hayvan konakçısında ortaya çıktı.
Delta Varyantı Dünya Çapında Nasıl Dominant Oldu?
Delta, alfa varyantından yüzde 40 ila yüzde 60 arasında daha fazla bulaşıcıdır ve ilk olarak Çin'de tanımlanan orijinal SARS-CoV-2 virüsünden neredeyse iki kat daha fazla bulaşıcıdır. Delta varyantının yüksek geçirgenliği , araştırmacıların baskın tür olmak için diğer varyantları geride bırakabileceğine inanmalarının başlıca nedenidir.
Viral zindelikte önemli bir faktör , replikasyon oranıdır - veya bir virüsün ne kadar hızlı kendini kopyalayabildiğidir. Delta varyantı , önceki SARS-CoV-2 varyantlarından daha hızlı çoğalıyor ve henüz hakemli olmayan bir çalışma , öncekilerden 1.000 kat daha fazla virüs parçacığı ürettiğini tahmin ediyor.
Ek olarak, delta varyantı ile enfekte olan insanlar daha fazla virüs üretiyor ve saçıyor, bu da yayılma kabiliyetinin artması için başka bir potansiyel mekanizma . Araştırmalar, delta varyantının çoğalma yeteneğinin artması için olası bir açıklamanın, spike proteinindeki mutasyonların, spike proteinin ACE-2 reseptörü aracılığıyla konakçısına daha verimli bağlanmasına yol açmasıdır.
Delta varyantı ayrıca vücudun istilacı bir virüse karşı savunmasında kritik bir rol oynayan nötralize edici antikorlardan kaçmasına izin verecek mutasyonlar da edinmiştir . Bu, birçok raporun gösterdiği gibi, COVID-19 aşılarının delta varyantına karşı neden biraz daha az etkili olduğunu açıklayabilir . Bu yüksek bulaşıcılık ve bağışıklıktan kaçınma kombinasyonu , delta varyantının nasıl bu kadar başarılı olduğunu açıklamaya yardımcı olabilir .
Araştırmalar ayrıca delta varyantı ile enfekte olan kişilerin, orijinal SARS-CoV-2 ve erken varyantları ile enfekte olanlara kıyasla hastaneye yatırılma riskinin daha yüksek olduğunu gösteriyor. Delta varyantının başak proteini üzerindeki belirli bir mutasyonun - P681R mutasyonunun - hücrelere girme ve daha ciddi hastalıklara neden olma yeteneğinin artmasına önemli bir katkıda bulunduğu düşünülmektedir .
Omicron Delta'nın Yerini Alacak mı?
Omicron varyantının deltadan daha uygun olup olmayacağını veya baskın hale gelip gelmeyeceğini söylemek için henüz çok erken. Omicron, delta varyantı ile bazı mutasyonları paylaşır, ancak oldukça farklı olan diğerlerine de sahiptir. Ancak araştırma topluluğunda özellikle endişe duymamızın nedenlerinden biri, omikron varyantının reseptör bağlama alanında - ACE-2 reseptörü ile etkileşime giren ve hücrelere girişe aracılık eden spike protein parçası - 10 mutasyona sahip olmasıdır. delta varyantı için sadece iki tane.
Diyelim ki omicron'daki tüm mutasyonların kombinasyonu, onu deltadan daha bulaşıcı veya bağışıklık kaçırmada daha iyi kılıyor. Bu durumda, bu varyantın küresel olarak yayılmasını görebiliriz. Bununla birlikte, alışılmadık derecede yüksek sayıda mutasyonun virüse zarar vermesi ve onu kararsız hale getirmesi de mümkündür.
Omicron varyantının oyunun sonu olmaması ve daha fazla SARS-CoV-2 varyantının ortaya çıkması kuvvetle muhtemeldir. SARS-CoV-2 insanlar arasında yayılmaya devam ettikçe , doğal seleksiyon ve adaptasyon, deltadan daha bulaşıcı olabilecek daha fazla varyantla sonuçlanacaktır.
İnfluenza virüslerinden viral adaptasyon sürecinin asla bitmediğini biliyoruz . Birçok ülke arasında daha düşük aşılama oranları , virüse karşı hala çok sayıda duyarlı konakçının olduğu ve yayılmaya ve yayılabildiği sürece mutasyona uğramaya devam edeceği anlamına geliyor. Omicron varyantının ortaya çıkması, SARS-CoV-2'nin daha fazla yayılmasını ve evrimini durdurmak için aşılamanın aciliyetinin bir başka hatırlatıcısıdır.
Suresh V. Kuchipudi , Penn State Üniversitesi'nde ortaya çıkan bulaşıcı hastalıklar profesörüdür. ABD Ulusal Sağlık Enstitüleri, ABD Tarım Bakanlığı ve ABD Ulusal Bilim Vakfı'ndan fon almaktadır.
Bu makale, Creative Commons lisansı altında The Conversation'dan yeniden yayınlanmıştır. Orijinal makaleyi burada bulabilirsiniz .