Celebrando gli alunni

Nov 25 2022

Niente, assolutamente niente, batte vedere un ricercatore all'inizio della carriera sbocciare in un brillante scienziato e leader. Questa settimana ha portato a fuoco i successi dei nostri alumni di laboratorio.

Citare come: Kamoun, S. (2022). Celebrando gli ex studenti.Zenodo https://doi.org/10.5281/zenodo.7358976

In questa settimana umida e fredda del 21 novembre 2022, una serie di incontri ed eventi legati agli ex studenti ha portato a mettere a fuoco la commovente sensazione di ritrovarsi con vecchi amici e colleghi. Niente, assolutamente niente, batte vedere un ricercatore all'inizio della carriera sbocciare in un brillante scienziato e leader. Queste sono le loro storie.

Cacciatori di Oxford

Il laboratorio del mio collega dell'Università di Oxford, Renier van der Hoorn , ha aperto la strada a studi su come le idrolasi delle piante siano coinvolte in una corsa agli armamenti coevolutiva con inibitori dei patogeni, contribuendo così a definire l'importanza dell'immunità apoplastica. La caccia a nuovi inibitori dei patogeni continua. Tee e Jie sono fondamentali nella squadra di cacciatori di inibitori dell'idrolasi di Renier . Lunedì mi sono fermato al laboratorio di Renier per aggiornarmi sul suo lavoro e ho incontrato Tee e Jie tra gli altri.

Tee Nattapong è entrato a far parte del laboratorio nel luglio 2014 come parte della International Undergraduate Summer School , un programma organizzato congiuntamente dal John Innes Center e dal Sainsbury Laboratory (TSL). Ha lavorato a stretto contatto con uno scienziato esperto nel laboratorio Vladimir Nekrasov , attualmente presso Rothamsted Research.

I nostri studenti universitari dell'estate 2014: Nattapong (Tee) Sanguankiattichai dalla Thailandia tramite l'Imperial College e Egem Ozbudak, Izmir Institute of Technology, Turchia. Nattapong sta lavorando con Vladimir Nekrasov ed Egem con Yasin Dagdas.

Tee ha continuato a fare un master all'Imperial College , facendo ricerche e contribuendo a uno studio sugli effettori patogeni con un altro ex allievo di laboratorio Tolga Bozkurt , prima di trasferirsi a Oxford per il suo dottorato di ricerca con Gail Preston e l'attuale postdoc con Renier. Controlla il recente articolo di revisione di Tee su come i batteri superano il rilevamento della flagellina da parte delle piante .

Jie Huang è un altro membro dei cacciatori di Oxford che è collegato al nostro laboratorio. Prima di trasferirsi a Oxford, Jie ha lavorato con l'allume di laboratorio Suomeng Dong presso la Nanjing Agricultural University (NJAU). Alla NJAU, Jie ha pubblicato una serie di articoli sugli effettori del killer delle piante Phytophthora , dimostrando più recentemente che l'agente patogeno modula lo splicing alternativo dell'mRNA dell'ospite .

Vincitori dell'Euro

Le sovvenzioni del Consiglio europeo della ricerca (CER) forniscono generosi finanziamenti quinquennali agli scienziati in tutte le fasi della carriera. Le sovvenzioni iniziali dell'ERC sono offerte ai candidati con meno di 7 anni di esperienza dopo il dottorato di ricerca. Queste sovvenzioni possono potenziare il lavoro dei ricercatori all'inizio della carriera (ECR) fornendo finanziamenti stabili che consentono ricerche rischiose ed esplorative, esattamente ciò che gli ECR dovrebbero essere incoraggiati a fare. Martedì ha portato la meravigliosa notizia che uno scienziato del Sainsbury Lab, Thorsten Langner , e due alunni, Miriam Oses-Ruiz e Annis Richardson , hanno ricevuto un #ERCStg nell'ultimo round di finanziamento del 2022 .

Come visto sul sito Web di The Sainsbury Lab , la notizia ha portato a festeggiamenti esultanti non solo da parte dei candidati prescelti, ma anche dai loro colleghi:

“ Era chiaro dall'energia eccitata alla doppia celebrazione improvvisata del laboratorio che i membri del TSL considerano i successi dei ricercatori all'inizio della carriera come i nostri successi più orgogliosi. In qualità di istituto lungimirante, crediamo che il nostro maggiore impatto per un futuro sostenibile sarà attraverso lo sviluppo di leader nella scienza delle piante. "

In effetti, cos'altro porta più gioia che assistere al successo dei nostri ECR?

Thorsten e Miriam sono Master Blasters, entrambi lavorano su aspetti della biologia e della patologia del temibile fungo esplosivo noto come Magnaporthe oryzae . Il progetto Thorsten si concentra su un ceppo pandemico di questo fungo, che sta causando danni al grano nel sud-est asiatico e in Africa . Come ha scritto Thorsten, ha in programma di " progettare recettori immunitari del grano contro il fungo pandemico del grano trasformando i punti deboli dell'ospite in una strategia di difesa ".

Il progetto PANDEMIC di Thorsten Langner sul fungo dell'esplosione del grano.

Thorsten mira a raggiungere i suoi obiettivi concentrandosi sui geni effettori di virulenza che il fungo porta su una parte estranea del suo genoma, nota come mini-cromosoma.

Negli ultimi anni, Thorsten ha abbracciato la scienza aperta e la prestampa, come discusso in questo post precedente . Ad esempio, il suo documento principale sui mini-cromosomi è stato preceduto da mini-documenti sul metodo e sui set di dati che ha condiviso con la comunità prima della pubblicazione formale sulla rivista PLOS Pathogens. Il suo abbraccio alla scienza aperta è stato debitamente notato dai membri del panel dell'ERC mentre hanno scritto nel riepilogo della decisione: “ L'impegno del candidato per la pubblicazione prestampata e la condivisione dei dati aperti sono particolarmente encomiabili. Complimenti Thorsten. Forse questo esempio mostra che non basta pubblicare su alcune riviste per convincere revisori e relatori del valore e dell'impatto del proprio lavoro.

Uno sguardo alle cose a venire - Le agenzie di finanziamento stanno valutando sempre più la dedizione dei candidati alla scienza aperta.

Miriam è attualmente ricercatrice Ramon y Cajal presso l'Università di Navarra in Spagna. Ha fatto il suo dottorato di ricerca. nel laboratorio dell'Università di Exeter del mago dei funghi esplosivi Nick Talbot prima di unirsi a lui a Norwich quando ha assunto la carica di Direttore Esecutivo di TSL. Tuttavia, il legame di Miriam con TSL risale a prima del suo dottorato di ricerca. Nel 2008, ha fatto un predoc nel nostro gruppo lavorando con Joe Win su progetti di patologia vegetale molecolare. Lasciatevi ispirare da Miriam, giovani! Fai un predoc prima di iniziare il tuo dottorato di ricerca .

Addio a Miriam Oses-Ruiz che sta tornando a Pamplona, in Spagna, dopo aver completato il suo tirocinio. [15 ottobre 2008]

Miriam vuole “conoscere il nemico” . Mira a comprendere il processo di eterogeneità cellulare nel fungo blastico ea determinare come si collega alla capacità del patogeno di infettare le piante. Lo farà studiando le strutture fungine conosciute come appressoria che producono un'enorme forza fisica per rompere la superficie della pianta e penetrare nel tessuto vegetale.

Miriam e l'appressoria.

Annis è all'Institute of Molecular Plant Sciences dell'Università di Edimburgo , dove dirige il Plant Shape Lab . Il laboratorio mira a capire come prendono forma foglie e fiori, un programma di ricerca che sarà sicuramente potenziato dai finanziamenti dell'ERC.

Più di 10 anni fa, prima di dedicarsi allo sviluppo delle piante, Annis è entrata a far parte del nostro laboratorio per una rotazione di dottorato con Sylvain Raffaele , un membro anziano del nostro team che alcuni anni dopo ha ottenuto la sua borsa di studio ERC mentre gestiva l' immunità quantitativa in Laboratorio piante (QIP) presso INRAe in Francia.

Nonostante la sua breve permanenza in laboratorio, Annis ha dato importanti contributi al lavoro che Sylvain, Tolga e altri stavano facendo all'epoca sull'identificazione dei processi cellulari dell'ospite che l'agente patogeno della carestia di patate irlandese Phytophthora infestans coopta per infettare le piante. Ciò ha portato Annis a scrivere insieme un articolo che è stato pubblicato sulla copertina della rivista Plant Physiology .

Bozkurt, Richardson et al. copertina che mostra il potente agente patogeno della peronospora della patata che invade il tessuto vegetale.

Premio Rosalind Franklin

Martedì sera, alcuni di noi si sono diretti alla Royal Society di Londra per assistere alla conferenza di Diane Saunders , "come superare in astuzia un killer di cereali". Diane è una fitopatologa del John Innes Center. È stata riconosciuta dalla Royal Society non solo per la sua eccezionale ricerca - è un'altra vincitrice del premio ERC - ma anche per il programma #WomeninWheat che ha messo insieme per ispirare e aiutare a far avanzare le carriere degli ECR.

Diane è entrata a far parte del Kamoun Lab nel gennaio 2010 dopo aver completato il suo dottorato di ricerca con Nick Talbot, allora all'Università di Exeter, lavorando sul fungo esplosivo. Siamo tutti collegati in una certa misura. La rete accademica è interconnessa come una rete di ife fungine.

[3 gennaio 2010] Nuovo membro del laboratorio: Diane Saunders, precedentemente studentessa di dottorato con Nick Talbot, Università di Exeter.

La conferenza di Diane alla Royal Society è stata una lezione magistrale di comunicazione scientifica. Il suo è un altro esempio di come per essere uno scienziato di successo richieda qualcosa di più che cercare articoli su certe riviste. Posso far risalire l'amore di Diane per la fantascienza al lavoro che ha svolto sull'epidemia di ash dieback a partire dal 2012, quando era alla TSL. A quel tempo, lavorando con Kentaro Yoshida - ora all'Università di Kyoto - e Dan MacLean di TSL , Diane ha aperto la strada all'applicazione della scienza aperta e del sequenziamento rapido del genoma alle emergenze fitosanitarie - un approccio che ha poi applicato alle malattie della ruggine del grano e che abbiamo usato per indagare sull'attuale pandemia di esplosione del grano .

Diane Saunders, qui sullo sfondo con Kentaro Yoshida, Anne Edwards e con Dan MacLean che mostra il progetto OpenAshDieback.

Che settimana, eh?

"Capitano, è mercoledì", dice il famoso meme di Tintin . Ci sono molte altre storie di allume da condividere. Alcuni di questi possono essere trovati tramite questa ricerca su Twitter .