Célébrer les diplômés

Rien - absolument rien - ne vaut le fait de voir un chercheur en début de carrière s'épanouir en un brillant scientifique et leader. Cette semaine a mis l'accent sur les réussites de nos anciens du laboratoire.

Citer comme suit : Kamoun, S. (2022). Célébrer les anciens.Zenodo https://doi.org/10.5281/zenodo.7358976

Au cours de cette semaine humide et froide du 21 novembre 2022, une série de rencontres et d'événements liés aux anciens élèves ont mis l'accent sur le sentiment réconfortant de retrouver d'anciens amis et collègues. Rien - absolument rien - ne vaut le fait de voir un chercheur en début de carrière s'épanouir en un brillant scientifique et leader. Ce sont leurs histoires.

Chasseurs d'Oxford

Le laboratoire de mon collègue de l'Université d'Oxford, Renier van der Hoorn , a été le pionnier des études sur la façon dont les hydrolases végétales sont prises dans une course aux armements coévolutionnaire avec des inhibiteurs d'agents pathogènes, aidant ainsi à définir l'importance de l'immunité apoplastique. La chasse aux nouveaux inhibiteurs de pathogènes continue. Tee et Jie sont des éléments clés de l'équipe de chasseurs d'inhibiteurs d'hydrolase de Renier . Lundi, je me suis arrêté au laboratoire de Renier pour rattraper son retard sur son travail et j'ai rencontré Tee et Jie entre autres.

Tee Nattapong a rejoint le laboratoire en juillet 2014 dans le cadre de l' International Undergraduate Summer School , un programme organisé conjointement par le John Innes Center et le Sainsbury Laboratory (TSL). Il a travaillé en étroite collaboration avec un scientifique expérimenté du laboratoire Vladimir Nekrasov – actuellement à Rothamsted Research.

Tee a ensuite fait une maîtrise à l'Imperial College , faisant de la recherche et contribuant à une étude sur les effecteurs pathogènes avec un autre ancien du laboratoire, Tolga Bozkurt , avant de déménager à Oxford pour son doctorat avec Gail Preston et son postdoctorat actuel avec Renier. Consultez le récent article de revue de Tee sur la façon dont les bactéries surmontent la détection de la flagelline par les plantes .

Jie Huang est un autre membre des chasseurs d'Oxford qui est connecté à notre laboratoire. Avant de déménager à Oxford, Jie a travaillé avec l'ancien laboratoire Suomeng Dong à l'Université agricole de Nanjing (NJAU). Au NJAU, Jie a publié un certain nombre d'articles sur les effecteurs du tueur de plantes Phytophthora , démontrant plus récemment que l'agent pathogène module l'épissage alternatif de l'ARNm de l'hôte .

Gagnants de l'Euro

Les bourses du Conseil européen de la recherche (ERC) offrent un financement généreux sur 5 ans aux scientifiques à tous les stades de leur carrière. Les bourses de démarrage ERC sont proposées aux candidats ayant moins de 7 ans d'expérience après leur doctorat. Ces subventions peuvent dynamiser le travail des chercheurs en début de carrière (ECR) en fournissant un financement stable qui permet des recherches risquées et exploratoires - précisément ce que les ECR devraient être encouragés à faire. Mardi a apporté la merveilleuse nouvelle qu'un scientifique du Sainsbury Lab, Thorsten Langner , et deux anciens élèves, Miriam Oses-Ruiz et Annis Richardson , ont reçu un #ERCStg lors du dernier cycle de financement de 2022 .

Comme on le voit sur le site Web du Sainsbury Lab , la nouvelle a donné lieu à des célébrations jubilatoires non seulement par les candidats retenus, mais aussi par leurs collègues :

« Il était clair, d'après l'énergie excitée lors de la double célébration impromptue du laboratoire, que les membres de TSL considèrent les succès des chercheurs en début de carrière comme nos réalisations les plus fières. En tant qu'institut tourné vers l'avenir, nous pensons que notre plus grand impact pour un avenir durable se fera par le développement de leaders en phytologie. ”

En effet, quoi d'autre apporte plus de joie que d'être témoin du succès de nos ECR ?

Thorsten et Miriam sont des maîtres blasters, tous deux travaillant sur des aspects de la biologie et de la pathologie du redoutable champignon explosif connu sous le nom de Magnaporthe oryzae . Le projet Thorsten se concentre sur une souche pandémique de ce champignon, qui fait des ravages sur le blé en Asie du Sud-Est et en Afrique . Comme Thorsten l'a écrit, il prévoit de « concevoir des récepteurs immunitaires du blé contre le champignon pandémique de la pyrale du blé en transformant les points faibles de l'hôte en une stratégie de défense ».

Thorsten vise à atteindre ses objectifs en se concentrant sur les gènes effecteurs de virulence que le champignon porte sur une partie étrangère de son génome, connue sous le nom de mini-chromosome.

Au cours des dernières années, Thorsten a adopté la science ouverte et la préimpression, comme indiqué dans cet article précédent . Par exemple, son article majeur sur les mini-chromosomes a été précédé de mini-articles sur la méthode et les ensembles de données qu'il a partagés avec la communauté avant la publication officielle dans la revue PLOS Pathogens. Son adhésion à la science ouverte a été dûment notée par les panélistes de l'ERC, comme ils l'ont écrit dans le résumé de la décision : « L'engagement du candidat envers la publication préimprimée et le partage de données ouvertes est particulièrement louable. ” Félicitations Thorsten. Cet exemple montre peut-être qu'il faut plus que publier dans certaines revues pour convaincre les examinateurs et les panélistes de la valeur et de l'impact de votre travail.

Miriam est actuellement chercheuse Ramon y Cajal à l'Université de Navarre en Espagne. Elle a fait son doctorat. dans le laboratoire de l'Université d'Exeter du magicien des champignons explosifs Nick Talbot avant de le rejoindre à Norwich lorsqu'il a pris le poste de directeur exécutif de TSL. Cependant, la connexion de Miriam à TSL remonte à avant son doctorat. En 2008, elle a fait un prédoctorat dans notre groupe en travaillant avec Joe Win sur des projets de pathologie végétale moléculaire. Laissez-vous inspirer par Miriam, les jeunes ! Faites un prédoc avant de commencer votre doctorat .

Myriam veut "connaître l'ennemi" . Elle vise à comprendre le processus d'hétérogénéité cellulaire chez le champignon blastique et à déterminer son lien avec la capacité de l'agent pathogène à infecter les plantes. Pour ce faire, elle étudiera les structures fongiques connues sous le nom d'appressoriums qui produisent une force physique énorme pour rompre la surface de la plante et pénétrer les tissus végétaux.

Annis travaille à l' Institute of Molecular Plant Sciences de l'Université d'Édimbourg où elle dirige le Plant Shape Lab . Le Lab vise à comprendre comment les feuilles et les fleurs se forment, un programme de recherche qui sera sûrement boosté par le financement ERC.

Il y a plus de 10 ans, avant de se consacrer au développement des plantes, Annis a rejoint notre laboratoire pour une rotation doctorale avec Sylvain Raffaele , un membre senior de notre équipe qui a obtenu quelques années plus tard sa propre bourse ERC tout en dirigeant le Quantitative Immunity in Laboratoire Plantes (QIP) à l'INRAe en France.

Malgré son court séjour au laboratoire, Annis a apporté d'importantes contributions au travail que Sylvain, Tolga et d'autres faisaient à l'époque sur l'identification des processus cellulaires hôtes que le pathogène irlandais de la famine de la pomme de terre Phytophthora infestans coopte pour infecter les plantes. Cela a conduit Annis à co-écrire un article qui a fait la couverture de la revue Plant Physiology .

Récipiendaire du prix Rosalind Franklin

Mardi soir, nous étions nombreux à nous rendre à la Royal Society de Londres pour assister à la conférence de Diane Saunders , « comment déjouer un tueur de céréales ». Diane est phytopathologiste au John Innes Centre. Elle a été reconnue par la Royal Society non seulement pour ses recherches exceptionnelles - elle est une autre lauréate de l'ERC - mais aussi pour le programme #WomeninWheat qu'elle a mis en place pour inspirer et aider à faire progresser la carrière des ECR.

Diane a rejoint le Kamoun Lab en janvier 2010 après avoir terminé son doctorat avec Nick Talbot - alors à l'Université d'Exeter - travaillant sur le champignon du souffle. Nous sommes tous connectés à un certain degré. Le réseau académique est aussi interconnecté qu'un maillage d'hyphes de champignons.

La conférence de Diane à la Royal Society était une classe de maître en communication scientifique. Le sien est un autre exemple de la façon dont être un scientifique prospère ne se limite pas à rechercher des articles dans certaines revues. Je peux retracer l'amour de Diane pour la science-fiction au travail qu'elle a effectué sur l'épidémie de dépérissement des cendres à partir de 2012 lorsqu'elle était à TSL. À cette époque, en travaillant avec Kentaro Yoshida - maintenant à l'Université de Kyoto - et Dan MacLean de TSL , Diane a été la pionnière de l'application de la science ouverte et du séquençage rapide du génome aux urgences phytosanitaires - une approche qu'elle a ensuite appliquée aux maladies de la rouille du blé , et que nous avons utilisé pour enquêter sur la pandémie actuelle de pyrale du blé .

Quelle semaine, hein ?

« Capitaine, c'est mercredi », dit le célèbre mème Tintin . Il y a beaucoup d'autres histoires d'alun à partager. Certains d'entre eux peuvent être trouvés grâce à cette recherche sur Twitter .

Remerciements

Ce poste est dédié à tous les membres du laboratoire, passés et présents. Merci de partager et de diffuser votre passion pour la science.