Świętują absolwenci

Nov 25 2022
Nic – absolutnie nic – nie przebije widoku początkującego badacza, który wyrasta na genialnego naukowca i lidera. Ten tydzień przyniósł skupienie się na sukcesach naszych absolwentów laboratorium.

Nic – absolutnie nic – nie przebije widoku początkującego badacza, który wyrasta na genialnego naukowca i lidera. Ten tydzień przyniósł skupienie się na sukcesach naszych absolwentów laboratorium.

Cytowanie jako: Kamoun, S. (2022). Świętujemy absolwentów.Zenodo https://doi.org/10.5281/zenodo.7358976

W tym mokrym i zimnym tygodniu 21 listopada 2022 r. seria spotkań i wydarzeń związanych z absolwentami skupiła się na ciepłym uczuciu spotkania ze starymi przyjaciółmi i współpracownikami. Nic – absolutnie nic – nie przebije widoku początkującego badacza, który wyrasta na genialnego naukowca i lidera. To są ich historie.

Łowcy z Oksfordu

Laboratorium mojego kolegi z Uniwersytetu Oksfordzkiego, Reniera van der Hoorna , zapoczątkowało badania nad tym, w jaki sposób hydrolazy roślinne są uwikłane w koewolucyjny wyścig zbrojeń z inhibitorami patogenów, pomagając w ten sposób określić znaczenie odporności apoplastycznej. Polowanie na nowe inhibitory patogenów trwa. Tee i Jie są kluczowymi członkami zespołu łowców inhibitorów hydrolazy Reniera . W poniedziałek wstąpiłem do laboratorium Reniera, żeby nadrobić zaległości w pracy i spotkałem się między innymi z Tee i Jie.

Tee Nattapong dołączył do laboratorium w lipcu 2014 roku w ramach International Undergraduate Summer School , programu zorganizowanego wspólnie przez John Innes Center i The Sainsbury Laboratory (TSL). Ściśle współpracował z doświadczonym naukowcem z laboratorium Władimirem Niekrasowem — obecnie w Rothamsted Research.

Nasi studenci latem 2014 roku: Nattapong (Tee) Sanguankiattichai z Tajlandii za pośrednictwem Imperial College i Egem Ozbudak, Izmir Institute of Technology, Turcja. Nattapong pracuje z Vladimirem Nekrasovem, a Egem z Yasinem Dagdasem.

Następnie Tee uzyskał tytuł magistra w Imperial College , prowadząc badania i przyczyniając się do badań nad efektorami patogenów z innym absolwentem laboratorium, Tolgą Bozkurtem , zanim przeniósł się do Oksfordu, aby uzyskać doktorat u Gail Preston i obecnie podoktorancki u Reniera. Sprawdź najnowszy artykuł przeglądowy Tee na temat tego, jak bakterie pokonują wykrywanie flageliny przez rośliny .

Jie Huang jest kolejnym członkiem myśliwych z Oksfordu, który jest powiązany z naszym laboratorium. Przed przeprowadzką do Oksfordu Jie pracowała z absolwentem laboratorium Suomeng Dong na Nanjing Agricultural University (NJAU). W NJAU Jie opublikował szereg artykułów na temat efektorów zabójcy roślin Phytophthora , ostatnio wykazując, że patogen moduluje alternatywny splicing mRNA gospodarza .

Zwycięzcy Euro

Granty Europejskiej Rady ds. Badań Naukowych (ERBN) zapewniają hojne 5-letnie finansowanie naukowcom na wszystkich etapach kariery. Granty ERC Starting są oferowane kandydatom z mniej niż 7-letnim doświadczeniem po uzyskaniu stopnia doktora. Granty te mogą przyspieszyć pracę badaczy rozpoczynających karierę zawodową (ECR), zapewniając stabilne finansowanie, które umożliwia ryzykowne i odkrywcze badania – dokładnie do tego, do czego należy zachęcać ECR. Wtorek przyniósł wspaniałą wiadomość, że jeden naukowiec z Sainsbury Lab, Thorsten Langner , oraz dwóch absolwentów, Miriam Oses-Ruiz i Annis Richardson , otrzymali #ERCStg w ostatniej rundzie finansowania w 2022 roku .

Jak widać na stronie internetowej The Sainsbury Lab , wiadomość wywołała radosne świętowanie nie tylko przez zwycięskich kandydatów, ale także przez ich kolegów:

„ Energia towarzysząca zaimprowizowanemu podwójnemu świętowaniu w laboratorium jasno pokazała, że ​​członkowie TSL postrzegają sukcesy badaczy rozpoczynających karierę jako nasze największe osiągnięcia. Jako instytut wybiegający w przyszłość wierzymy, że nasz największy wpływ na zrównoważoną przyszłość będzie miał rozwój liderów w dziedzinie nauk o roślinach. ”

Rzeczywiście, co jeszcze sprawia większą radość niż obserwowanie sukcesu naszych ECR?

Thorsten i Miriam to mistrzowie miotaczy, obaj zajmujący się aspektami biologii i patologii przerażającego grzyba wybuchowego znanego jako Magnaporthe oryzae . Projekt Thorsten koncentruje się na pandemicznym szczepie tego grzyba, który sieje spustoszenie w pszenicy w Azji Południowo-Wschodniej i Afryce . Jak napisał Thorsten, planuje „ zaprojektować receptory immunologiczne pszenicy przeciwko pandemicznemu grzybowi zarazy pszenicy, zmieniając słabe punkty żywiciela w strategię obronną ”.

Projekt PANDEMIC Thorstena Langnera dotyczący grzyba zarazy pszenicy.

Thorsten dąży do osiągnięcia swoich celów, skupiając się na genach efektorowych wirulencji, które grzyb przenosi na zewnętrznej części swojego genomu, znanej jako mini-chromosom.

W ciągu ostatnich lat Thorsten przyjął otwartą naukę i przygotowanie do druku, o czym była mowa we wcześniejszym poście . Na przykład jego główny artykuł na temat mini-chromosomów został poprzedzony mini-artykułami dotyczącymi metod i zestawów danych, którymi podzielił się ze społecznością przed oficjalną publikacją w czasopiśmie PLOS Pathogens. Jego poparcie dla otwartej nauki zostało należycie zauważone przez panelistów ERC, którzy napisali w podsumowaniu decyzji: „ Szczególnie godne pochwały jest zaangażowanie wnioskodawcy w publikację przed drukiem i udostępnianie otwartych danych. „Chwała Thorstenowi. Być może ten przykład pokazuje, że potrzeba czegoś więcej niż opublikowania w niektórych czasopismach, aby przekonać recenzentów i panelistów o wartości i wpływie Twojej pracy.

Rzut oka na to, co ma nadejść — agencje finansujące coraz częściej oceniają zaangażowanie wnioskodawców w otwartą naukę.

Miriam jest obecnie stypendystką Ramon y Cajal Research Fellow na Uniwersytecie Nawarry w Hiszpanii. Zrobiła doktorat. w laboratorium Uniwersytetu Exeter, prowadzonego przez Nicka Talbota , czarodzieja grzybów wybuchowych, zanim dołączył do niego w Norwich, kiedy objął stanowisko dyrektora wykonawczego TSL. Jednak związek Miriam z TSL sięga okresu przed uzyskaniem doktoratu. W 2008 roku zrobiła predoc w naszej grupie, pracując z Joe Winem nad projektami molekularnej patologii roślin. Zainspirujcie się Miriam, młodzi ludzie! Zrób predoc przed rozpoczęciem doktoratu .

Pożegnanie Miriam Oses-Ruiz, która wraca do Pampeluny w Hiszpanii po ukończeniu stażu. [15 października 2008]

Miriam chce „poznać wroga” . Jej celem jest zrozumienie procesu heterogeniczności komórkowej grzyba zarazy i określenie, w jaki sposób łączy się on ze zdolnością patogenu do infekowania roślin. Zrobi to, badając struktury grzybów znane jako appressoria , które wytwarzają ogromną siłę fizyczną, aby rozerwać powierzchnię rośliny i penetrować tkankę roślinną.

Miriam i appressoria.

Annis pracuje w Institute of Molecular Plant Sciences na Uniwersytecie w Edynburgu , gdzie prowadzi Plant Shape Lab . Laboratorium ma na celu zrozumienie, w jaki sposób liście i kwiaty uzyskują swój kształt, program badawczy, który z pewnością zostanie wzmocniony dzięki finansowaniu ERBN.

Ponad 10 lat temu, zanim Annis poświęciła się rozwojowi roślin, dołączyła do naszego laboratorium na rotację doktorancką z Sylvainem Raffaele , starszym członkiem naszego zespołu, który kilka lat później uzyskał własny grant ERC , prowadząc Ilościową Odporność w Plants (QIP) Lab w INRAe we Francji.

Pomimo krótkiego pobytu w laboratorium, Annis wniosła ważny wkład w prace, które Sylvain, Tolga i inni wykonywali w tamtym czasie nad identyfikacją procesów komórkowych żywiciela, które patogen głodu ziemniaczanego Phytophthora infestans kooptuje do infekowania roślin. W rezultacie Annis była współautorką artykułu, który znalazł się na okładce czasopisma Plant Physiology .

Bozkurt, Richardson i in. okładka przedstawiająca potężny patogen zarazy ziemniaczanej atakujący tkankę roślinną.

Nagroda Rosalind Franklin

We wtorek wieczorem część z nas udała się do Royal Society w Londynie, aby wziąć udział w wykładzie Diane Saunders „Jak przechytrzyć zabójcę zboża”. Diane jest patologiem roślin w John Innes Centre. Została doceniona przez Towarzystwo Królewskie nie tylko za wybitne badania — jest kolejną nagrodzoną ERC — ale także za program #WomeninWheat , który stworzyła, aby inspirować i pomagać w rozwoju karier ECR.

Diane dołączyła do Kamoun Lab w styczniu 2010 roku po ukończeniu doktoratu z Nickiem Talbotem – wówczas na University of Exeter – pracując nad grzybem wybuchowym. Wszyscy jesteśmy w jakimś stopniu połączeni. Sieć akademicka jest tak połączona jak siatka strzępek grzybów.

[3 stycznia 2010 r.] Nowy członek laboratorium: Diane Saunders, wcześniej doktorantka Nicka Talbota z University of Exeter.

Wykład Diane w Towarzystwie Królewskim był mistrzowską klasą komunikacji naukowej. Jej jest kolejnym przykładem tego, że bycie odnoszącym sukcesy naukowcem wymaga czegoś więcej niż tylko pogoni za artykułami w niektórych czasopismach. Mogę prześledzić miłość Diane do scicomu do pracy, którą wykonała w związku z wybuchem zamierania jesionu, począwszy od 2012 roku, kiedy pracowała w TSL. W tym czasie, współpracując z Kentaro Yoshidą — obecnie na Uniwersytecie w Kioto — i Danem MacLeanem z TSL , Diane była pionierem zastosowania otwartej nauki i szybkiego sekwencjonowania genomu w sytuacjach zagrożenia zdrowia roślin — podejście, które zastosowała w przypadku chorób rdzy pszenicy i których użyliśmy do zbadania obecnej pandemii zarazy pszenicy .

Diane Saunders, tutaj w tle z Kentaro Yoshidą, Anne Edwards i Danem MacLeanem prezentują projekt OpenAshDieback.

Co za tydzień, co?

„Kapitanie, jest środa”, mówi słynny mem Tintina . Istnieje wiele innych historii absolwentów, którymi można się podzielić. Niektóre z nich można znaleźć za pomocą tej wyszukiwarki na Twitterze .

Podziękowanie

Ten post jest przeznaczony dla wszystkich członków laboratorium, byłych i obecnych. Dziękujemy za dzielenie się i szerzenie pasji do nauki.