tổng kết năm 2022

Năm 2022 là một năm buồn vui lẫn lộn đối với tôi.

Chúng tôi đã đạt được tiến bộ to lớn trong việc tiếp tục phát triển nền tảng khám phá thuốc tính toán dựa trên vật lý và tăng cường ML. Chúng tôi đã xây dựng một công cụ trường lực thế hệ tiếp theo với độ chính xác tiên tiến nhất và phạm vi hóa học toàn diện, chúng tôi đã thiết kế lại một chương trình dự đoán năng lượng tự do liên kết mạnh mẽ và thích ứng với thông lượng, độ bền và độ chính xác vô song, chúng tôi đã phát triển các phương pháp mới để tích hợp dữ liệu thực nghiệm lý sinh vào các mô phỏng động lực học phân tử tiên tiến để xây dựng các mô hình thực tế về cấu trúc và động lực học của protein, đồng thời chúng tôi đã xây dựng các phương pháp và mô hình cho các ứng dụng theo phương thức cụ thể để cho phép thiết kế hợp lý dựa trên cấu trúc và động lực học của các chất phân hủy protein được nhắm mục tiêu và để hỗ trợ việc phát hiện ra các chất ức chế cộng hóa trị.

Quan trọng hơn, chúng tôi đã áp dụng thành công các công cụ tính toán này để cho phép và tăng tốc đáng kể quá trình khám phá thuốc thực tế, chẳng hạn như thiết kế các chất phân hủy hoạt tính mới dựa trên các cấu trúc phức tạp bậc ba được mô hình hóa trong các mô phỏng của chúng tôi mà trước đây không được quan sát nhưng sau đó được xác nhận trong tinh thể học, dự đoán chính xác hiệu quả phân hủy của thuốc mới. các phân tử lưỡng chức năng và làm phong phú thêm tỷ lệ phần trăm của các thiết kế chất ức chế tích cực gấp 5 lần so với mục tiêu ung thư có giá trị cao nhưng đầy thách thức.

Chúng tôi đã xuất bản một số bài báo báo cáo khoa học làm nền tảng cho nền tảng tính toán của chúng tôi:

• Tính toán năng lượng tự do liên kết chính xác cho nhiều phân tử bằng cách sử dụng mạng đo lường tối ưu về sự khác biệt theo cặp
• Dự đoán cơ sở cấu trúc của sự phân hủy protein mục tiêu bằng cách tích hợp các mô phỏng động lực học phân tử với phép đo khối phổ cấu trúc
• Mô hình hóa ảnh hưởng của sự hợp tác trong sự hình thành phức hợp ternary và sự thoái hóa protein được nhắm mục tiêu qua trung gian bởi các chất thoái hóa dị thể
• Đặc trưng cho tính linh hoạt của thụ thể để dự đoán các đột biến dẫn đến sự thích nghi của con người đối với Hemagglutinin cúm
• Sự gia tăng chậm nhưng ổn định của các tính toán năng lượng tự do ràng buộc trong khám phá thuốc

Điều cay đắng trong năm là tôi đã phải chia tay rất nhiều đồng nghiệp tài năng và tận tụy, những người có chung niềm đam mê khám phá thuốc. Tôi chúc tất cả các bạn tốt, bạn bè của tôi!

Bây giờ tôi mong chờ một năm mới của những cơ hội. Với tư cách là một nhóm độc lập, tập trung vào tính toán (như tôi đã dự tính trong bài đăng blog này ), chúng tôi sẽ mang nền tảng hỗ trợ khám phá thuốc trong Silicon Therapeutics và Roivant Discovery đến nhiều dự án khám phá thuốc hơn trong cộng đồng khám phá thuốc rộng rãi, để khuếch đại giá trị của nền tảng và giúp khám phá nhiều loại thuốc hơn cho bệnh nhân, nhanh hơn. Hãy theo dõi.

Chúc mừng năm mới và nghiên cứu hạnh phúc!