Xoay vòng từ định dạng rộng sang định dạng dài và sau đó lồng các cột
Tôi được cung cấp dữ liệu có định dạng rộng. Mỗi hàng liên quan đến một biến bên ngoài bảng hiện tại và các giá trị có thể có liên quan đến biến đó. Tôi đang cố gắng: (1) xoay sang định dạng dài và (2) lồng các giá trị đã xoay.
Thí dụ
library(tibble)
df_1 <-
tribble(~key, ~values.male, ~values.female, ~values.red, ~values.green, ~value,
"gender", 0.5, 0.5, NA, NA, NA,
"age", NA, NA, NA, NA, "50",
"color", NA, NA, TRUE, FALSE, NA,
"time_of_day", NA, NA, NA, NA, "noon")
## # A tibble: 4 x 6
## key values.male values.female values.red values.green value
## <chr> <dbl> <dbl> <lgl> <lgl> <chr>
## 1 gender 0.5 0.5 NA NA NA
## 2 age NA NA NA NA 50
## 3 color NA NA TRUE FALSE NA
## 4 time_of_day NA NA NA NA noon
Trong ví dụ này, chúng ta thấy rằng gendercó thể có female = 0.5và male = 0.5. Mặt khác, agecó thể chỉ có một giá trị duy nhất là 50. Từ hàng số 3, chúng ta biết rằng colorcó thể có các giá trị red = TRUEvà green = FALSE, và time_of_day = noon.
Do đó, một bảng xoay vòng phải có dạng lồng nhau là:
my_pivoted_df <-
structure(
list(
var_name = c("gender", "age", "color", "time_of_day"),
vals = list(
structure(
list(
level = c("male", "female"),
value = c(0.5,
0.5)
),
row.names = c(NA, -2L),
class = c("tbl_df", "tbl", "data.frame")
),
"50",
structure(
list(
level = c("red", "green"),
value = c(TRUE,
FALSE)
),
row.names = c(NA, -2L),
class = c("tbl_df", "tbl", "data.frame")
),
"noon"
)
),
row.names = c(NA, -4L),
class = c("tbl_df", "tbl",
"data.frame")
)
## # A tibble: 4 x 2
## var_name vals
## <chr> <list>
## 1 gender <tibble [2 x 2]>
## 2 age <chr [1]>
## 3 color <tibble [2 x 2]>
## 4 time_of_day <chr [1]>
Nỗ lực của tôi để giải quyết vấn đề này
Có một số vấn đề với df_1. Đầu tiên, việc đặt tên cho các cột hiện nay là không thuận tiện. Headers như valuekhông lý tưởng vì chúng mâu thuẫn với pivot_longer()'s ".value"cơ chế. Thứ hai, df_1có values(ở số nhiều) khi keycó nhiều hơn một tùy chọn (ví dụ: "đỏ" và "xanh" cho color), nhưng value(số ít) khi chỉ có một tùy chọn cho key(chẳng hạn như với age). Dưới đây là mã không thành công của tôi, lấy cảm hứng từ câu trả lời này .
library(tidyr)
library(dplyr)
df_1 %>%
rename_with( ~ paste(.x, "single", sep = "."), .cols = value) %>% ## changed the header because otherwise it breaks
pivot_longer(cols = starts_with("val"),
names_to = c("whatevs", ".value"), names_sep = "\\.")
## # A tibble: 8 x 7
## key whatevs male female red green single
## <chr> <chr> <dbl> <dbl> <lgl> <lgl> <chr>
## 1 gender values 0.5 0.5 NA NA NA
## 2 gender value NA NA NA NA NA
## 3 age values NA NA NA NA NA
## 4 age value NA NA NA NA 50
## 5 color values NA NA TRUE FALSE NA
## 6 color value NA NA NA NA NA
## 7 time_of_day values NA NA NA NA NA
## 8 time_of_day value NA NA NA NA noon
Tôi thiếu một số thủ thuật gây tranh cãi để giải quyết vấn đề này.
Trả lời
Một cách tiếp cận ngăn nắp để đạt được kết quả mong muốn của bạn có thể giống như sau:
library(tibble)
df_1 <-
tribble(~key, ~values.male, ~values.female, ~values.red, ~values.green, ~value,
"gender", 0.5, 0.5, NA, NA, NA,
"age", NA, NA, NA, NA, "50",
"color", NA, NA, TRUE, FALSE, NA,
"time_of_day", NA, NA, NA, NA, "noon")
library(tidyr)
library(dplyr)
library(purrr)
df_pivoted <- df_1 %>%
mutate(across(everything(), as.character)) %>%
pivot_longer(-key, names_to = "level", names_prefix = "^values\\.", values_drop_na = TRUE) %>%
group_by(key) %>%
nest() %>%
mutate(data = map(data, ~ if (all(.x$level == "value")) deframe(.x) else .x))
df_pivoted
#> # A tibble: 4 x 2
#> # Groups: key [4]
#> key data
#> <chr> <list>
#> 1 gender <tibble [2 × 2]>
#> 2 age <chr [1]>
#> 3 color <tibble [2 × 2]>
#> 4 time_of_day <chr [1]>
CHỈNH SỬA Sau khi làm rõ nhận xét của bạn về kết quả mong muốn, chúng tôi có thể chỉ cần loại bỏ câu lệnh bản đồ là kết thúc (về cơ bản có nghĩa là để chuyển đổi các ô vuông cho các danh mục không có cấp thành một vectơ) và thêm một câu lệnh biến đổi trước khi lồng vào nhau để thay thế cấp với NA cho các danh mục không có level:
pivot_nest <- function(x) {
mutate(x, across(everything(), as.character)) %>%
pivot_longer(-key, names_to = "level", names_prefix = "^values\\.", values_drop_na = TRUE) %>%
group_by(key) %>%
mutate(level = ifelse(all(level == "value"), NA_character_, level)) %>%
nest()
}
df_pivoted <- df_1 %>%
pivot_nest()
df_pivoted
#> # A tibble: 4 x 2
#> # Groups: key [4]
#> key data
#> <chr> <list>
#> 1 gender <tibble [2 × 2]>
#> 2 age <tibble [1 × 2]>
#> 3 color <tibble [2 × 2]>
#> 4 time_of_day <tibble [1 × 2]>
df_pivoted$data
#> [[1]]
#> # A tibble: 2 x 2
#> level value
#> <chr> <chr>
#> 1 male 0.5
#> 2 male 0.5
#>
#> [[2]]
#> # A tibble: 1 x 2
#> level value
#> <chr> <chr>
#> 1 <NA> 50
#>
#> [[3]]
#> # A tibble: 2 x 2
#> level value
#> <chr> <chr>
#> 1 red TRUE
#> 2 red FALSE
#>
#> [[4]]
#> # A tibble: 1 x 2
#> level value
#> <chr> <chr>
#> 1 <NA> noon
df_2 <- tribble(~key, ~value, "age", "50", "income", "100000", "time_of_day", "noon")
df_pivoted2 <- df_2 %>%
pivot_nest()
df_pivoted2
#> # A tibble: 3 x 2
#> # Groups: key [3]
#> key data
#> <chr> <list>
#> 1 age <tibble [1 × 2]>
#> 2 income <tibble [1 × 2]>
#> 3 time_of_day <tibble [1 × 2]>
df_pivoted2$data
#> [[1]]
#> # A tibble: 1 x 2
#> level value
#> <chr> <chr>
#> 1 <NA> 50
#>
#> [[2]]
#> # A tibble: 1 x 2
#> level value
#> <chr> <chr>
#> 1 <NA> 100000
#>
#> [[3]]
#> # A tibble: 1 x 2
#> level value
#> <chr> <chr>
#> 1 <NA> noon
Một tùy chọn sẽ trả về cùng loại đầu ra với đầu vào được cung cấp:
df_1 %>%
group_split(key) %>%
map_dfr(~ select(., where(~ !all(is.na(.)))) %>%
pivot_longer(-key, names_to = "level", names_prefix = "^values\\.") %>%
summarise(key = first(key),
vals = if(n() == 1) list(value) else list(tibble(level, value))))
key vals
<chr> <list>
1 age <chr [1]>
2 color <tibble [2 × 2]>
3 gender <tibble [2 × 2]>
4 time_of_day <chr [1]>
Cơ cấu đầu ra:
$ key : chr [1:4] "age" "color" "gender" "time_of_day" $ vals:List of 4
..$ : chr "50" ..$ : tibble [2 × 2] (S3: tbl_df/tbl/data.frame)
.. ..$ level: chr [1:2] "red" "green" .. ..$ value: logi [1:2] TRUE FALSE
..$ : tibble [2 × 2] (S3: tbl_df/tbl/data.frame) .. ..$ level: chr [1:2] "male" "female"
.. ..$ value: num [1:2] 0.5 0.5 ..$ : chr "noon"
Đây là một data.tablegiải pháp, bởi vì tôi cảm thấy thoải mái hơn với meltvà dcast, nhưng có thể dễ dàng chuyển nhượng thành dplyr:
library(data.table)
df <- setDT(df_1)
plouf <- melt(df,measure.vars = patterns("value")) %>%
.[!is.na(value),.(key,level = gsub("values.","",variable),value)]
điều này mang lại:
key level value
1: gender male 0.5
2: gender female 0.5
3: color red TRUE
4: color green FALSE
5: age value 50
6: time_of_day value noon
Bây giờ bạn chỉ có thể lặp lại các keygiá trị duy nhất để xuất ra những gì bạn muốn:
keylist <- unique(plouf$key)
result <- tibble(varname = keylist,
vals = lapply(keylist,function(x){
if(plouf[x == key,level[1]] != "value"){
plouf[x == key,.(level,value)]
}else{
plouf[x == key,value]
}
})
)
Tại đây, bạn có được mảnh ghép lồng nhau của mình (với data.tables và các ký tự bên trong)