Mặc dù những người theo đạo Cơ đốc ban đầu đã trải qua những cuộc bách hại nặng nề, nhưng đến thời Trung cổ , Giáo hội Công giáo đã có quyền lực chính trị và tôn giáo đáng kể ở châu Âu. Để duy trì quyền lực của mình, nhà thờ đã đàn áp những kẻ dị giáo. Nhà thờ có một định nghĩa rất cụ thể về tà giáo: Một kẻ dị giáo công khai niềm tin của mình (dựa trên những gì nhà thờ cho là những cách giải thích không chính xác của Kinh thánh) và từ chối tố cáo chúng, ngay cả sau khi được chính quyền sửa chữa. Anh ấy cũng cố gắng truyền dạy niềm tin của mình cho người khác. Anh ta phải làm những việc này bằng ý chí tự do của mình, không chịu sự tác động của ma quỷ.
Tòa án dị giáo chính thức bắt đầu với Giáo hoàng Gregory IX (Tòa án dị giáo của Giáo hoàng). Năm 1231, ông đã ban hành một sắc lệnh, hay một con bò đực , thiết lập một hệ thống tòa án trọng tài để xét xử những kẻ dị giáo và trừng phạt họ. Ông đã chọn Dòng Đa Minh, nổi tiếng là được giáo dục rất tốt và am hiểu về thần học phức tạp, để tiến hành Tòa án Dị giáo.
Tòa án dị giáo Tây Ban Nha đặc biệt ở chỗ nó được thành lập bởi các nhà cai trị thế tục, Vua Ferdinand II và Nữ hoàng Isabella, với sự chấp thuận của Giáo hoàng Sixtus IV. Chế độ quân chủ theo Công giáo và nó vừa thống nhất hai vương quốc, Aragon và Castile, thành một quốc gia duy nhất vào cuối thế kỷ 15. Các lý do cho Tòa án dị giáo bao gồm mong muốn tạo ra sự thống nhất tôn giáo và làm suy yếu các cơ quan chính trị địa phương và các liên minh gia đình. Tiền là một động cơ khác - chính phủ kiếm lời bằng cách tịch thu tài sản của những người bị kết tội tà giáo. Các nhà sử học suy đoán rằng chế độ quân chủ đã thuyết phục Giáo hoàng Sixtus IV cho phép tòa án dị giáo bằng cách đe dọa loại bỏ quân đội Tây Ban Nha khỏi Rome, nơi họ cần để ngăn chặn một cuộc tấn công của Thổ Nhĩ Kỳ.
Nhiều công dân nổi tiếng lo ngại về sự đa dạng tôn giáo của đất nước họ và có thái độ cố chấp đối với những người không theo Công giáo. Người Do Thái đã phải chịu các cuộc tấn công bạo lực được gọi là pogroms và bị cô lập trong các khu ổ chuột. Nhiều người đã thiệt mạng. Tòa án Dị giáo chính thức được thành lập vào năm 1478, và người Do Thái bị trục xuất vài năm sau đó khi Vua Ferdinand II ban hành Sắc lệnh Alhambra vào năm 1492, ra lệnh cho họ rời đi trong nỗi đau chết chóc. Nhiều người Do Thái đã cải sang đạo Công giáo. Những người cải đạo này đôi khi được gọi là marranos (tiếng Tây Ban Nha có nghĩa là "lợn" và một thuật ngữ rất xúc phạm) và bị buộc tội bí mật tiếp tục theo đạo Do Thái. Họ trở thành mục tiêu của Tòa án dị giáo.
Tây Ban Nha đã chinh phục Granada, một khu vực có dân cư chủ yếu là người Moor theo đạo Hồi, vào cuối thế kỷ 15. Người Hồi giáo phải chịu sự phản đối và ngược đãi tương tự như người Do Thái, cho đến khi họ bị trục xuất vào năm 1502 nhân danh sự thống nhất tôn giáo và văn hóa. Những người Hồi giáo cải đạo sang Công giáo, được gọi là Moriscos (tiếng Tây Ban Nha có nghĩa là "Người Moorish"), được nhắm mục tiêu vì những lý do tương tự như những người cải đạo Do Thái. Vào cuối thế kỷ 16, những người theo đạo Tin lành, chủ yếu là người Luther, cũng trở thành mục tiêu của Tòa án dị giáo.
Tòa án dị giáo Tây Ban Nha lan sang các thuộc địa do Tây Ban Nha kiểm soát ở Tân Thế giới, bao gồm cả Mexico. Tòa án dị giáo đã bị bãi bỏ ở Tây Ban Nha vào năm 1834 bởi Nữ hoàng Isabel II.
Chúng ta sẽ xem xét cách thức tiến hành các thử nghiệm thẩm vấn này tiếp theo.
Thêm nạn nhân của điều tra dị giáo
Nhà vật lý và thiên văn học người Ý Galilei Galileo (1564 - 1642) Những người Waldensians và Cathars, những thành viên của các phong trào tinh thần nổi tiếng và đe dọa quyền lực của Nhà thờ Công giáo, là mục tiêu chính của Tòa án Dị giáo thời Trung cổ.
Tòa án dị giáo Bồ Đào Nha tương tự như Tòa án dị giáo Tây Ban Nha ở chỗ nó hoạt động dưới chế độ quân chủ. Nó được thành lập vào năm 1536 và nhắm mục tiêu vào người Do Thái và những người cải đạo gần đây sang Cơ đốc giáo, cũng như các phù thủy bị buộc tội. Tòa án dị giáo Bồ Đào Nha mở rộng đến các thuộc địa Thế giới Mới của Bồ Đào Nha. Tòa án dị giáo của Bồ Đào Nha sau này, Tòa án dị giáo Goa, cũng nhắm mục tiêu vào những người theo đạo Hindu.
Tòa án dị giáo La Mã, được thành lập trong những năm 1540, tập trung vào các tội ác dị giáo của phù thủy , ma thuật và báng bổ. Một trong những trường hợp nổi tiếng nhất của nó là của Galileo Galilei.
