Sau hai phút tập thể dục, cơ thể đáp ứng để cung cấp oxy cho các cơ đang hoạt động. Khi có oxy, glucose có thể bị phân hủy hoàn toàn thành carbon dioxide và nước trong một quá trình gọi là hô hấp hiếu khí . Glucose có thể đến từ ba nơi khác nhau:
- nguồn cung cấp glycogen còn lại trong cơ
- phân hủy glycogen của gan thành glucose, đến cơ bắp hoạt động qua đường máu
- hấp thụ glucose từ thức ăn trong ruột, đến cơ bắp hoạt động qua đường máu
Hô hấp hiếu khí cũng có thể sử dụng axit béo từ chất béo dự trữ trong cơ và cơ thể để sản xuất ATP. Trong những trường hợp cực đoan (như chết đói), protein cũng có thể bị phân hủy thành các axit amin và được sử dụng để tạo ATP. Hô hấp hiếu khí sẽ sử dụng carbohydrate đầu tiên, sau đó là chất béo và cuối cùng là protein, nếu cần thiết. Hô hấp hiếu khí thậm chí còn diễn ra nhiều phản ứng hóa học hơn để tạo ra ATP so với một trong hai hệ thống trên. Hô hấp hiếu khí tạo ra ATP với tốc độ chậm nhất trong ba hệ thống, nhưng nó có thể tiếp tục cung cấp ATP trong vài giờ hoặc lâu hơn, miễn là việc cung cấp nhiên liệu kéo dài.
